急性胃粘膜病変 acute gastric mucosal lesion
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Two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) is a method used to separate complex protein mixtures by first separating the proteins according to their isoelectric point (pI) and then according to their molecular weight. This separation would then enable the scientist to identify the proteins according to their published pI and MW values or subject them to further separation or identification using Mass Spectrometry. 2-DE is a time consuming procedure resulting in copious amounts of raw data. Thus in order to use computational means to analyze the data in context, meaning full data structure are required/needed. These data standards are slow in coming due to complexity and integrative nature of knowledge required to develop this is sparse. Annotated Gel Markup Language, or AGML is an attempt to bridge this gap.
In spite of two-dimensional gel electrophoresis (2-DE) being an effective and widely used method to screen the proteome, its data standardization has still not matured to the level of microarray genomics data or mass spectrometry approaches. The trend toward identifying encompassing data standards has been expanding from genomics to transcriptomics, and more recently to proteomics. The relative success of genomic and transcriptomic data standardization has enabled the development of central repositories such as GenBank and Gene Expression Omnibus. An equivalent 2-DE-centric data structure would similarly have to include a balance among raw data, basic feature detection results, sufficiency in the description of the experimental context and methods, and an overall structure that facilitates a diversity of usages, from central reposition to local data representation in LIMs systems. Results & Conclusion: Achieving such a balance can only be accomplished through several iterations involving bioinformaticians, bench molecular biologists, and the manufacturers of the equipment and commercial software from which the data is primarily generated. Such an encompassing data structure is described here, developed as the mature successor to the well established and broadly used earlier version. A public repository, AGML Central, is configured with a suite of tools for the conversion from a variety of popular formats, web-based visualization, and interoperation with other tools and repositories, and is particularly mass-spectrometry oriented with I/O for annotation and data analysis. Structure language is especially important in this field and would greatly enable the transition of 2-D gel electrophoresis into the semantic realm. This would enable more meaningful searching of the data and eventual integration and relationship formation using computational algorithms (Adapted from Stanislaus et al. 2008 see http://www.biomedcentral.com/1471-2105/9/4/).
Annotated Gel Markup Language, or AGML, is a language that has been proposed to markup data obtained by 2-D gel electrophoresis based on the XML language. The eXtensible Markup Language (XML) is particularly well suited to represent biological data and methods and is the choice to do this in most areas. As such XML syntax notation was used to describe data acquired from 2-D gel electrophoresis and mass spectrometry. The goal of AGML is to enable proteomics research to move into the browsing mode of searching through existing databases.
The AGML Central project is part of a wider XML data model to represent 2-D gel electrophoresis data. In this regard the aim is to faithfully represent both the data/results and experimental protocols/methods used in producing the data. The major advantage in this comes from the fact that when analysing 2-D gel electrophoresis data stored in AGML (an XML data structure), all the pertinent information can be found in one data file. AGML 2.0 data structure can store data, both gel and mass spectrometry, and experimental methods through the use of MI2DG.
External links[edit]
- http://www.biomedcentral.com/1471-2105/5/9
- http://www.biomedcentral.com/1471-2105/9/4/
- http://www.agml.org
- http://ibl.mdanderson.org/agml
- http://bioinformatics.musc.edu/agml2
English Journal
- Efficient global maximum likelihood estimation through kernel methods.
- Cervellera C, Macciò D, Muselli M.SourceIstituto di Studi sui Sistemi Intelligenti per l'Automazione, Consiglio Nazionale delle Ricerche, Via de Marini 6, 16149 Genova, Italy. cervellera@ge.issia.cnr.it
- Neural networks : the official journal of the International Neural Network Society.Neural Netw.2010 Sep;23(7):917-25. Epub 2010 Mar 27.
- A new efficient technique for estimating probability densities from data through the application of the approximate global maximum likelihood (AGML) approach is proposed. It employs a composition of kernel functions to estimate the correct behavior of parameters involved in the expression of the unk
- PMID 20403677
- CMV quantitative PCR in the diagnosis of CMV-associated AGML in an immunocompetent host.
- Matsui Y, Sugino N, Kaneko H, Watanabe M, Miura Y, Tsudo M.
- Internal medicine (Tokyo, Japan).Intern Med.2010;49(12):1265-7; author reply 1269. Epub 2010 Jun 15.
- PMID 20558964
Japanese Journal
- The Authors Reply: CMV Quantitative PCR in the Diagnosis of CMV-associated AGML in an Immunocompetent Host
- CMV Quantitative PCR in the Diagnosis of CMV-associated AGML in an Immunocompetent Host
- Matsui Yusuke,Sugino Noriko,Kaneko Hitomi,Watanabe Mitsumasa,Miura Yasuo,Tsudo Mitsuru
- Internal Medicine 49(12), 1265-1267, 2010
- NAID 130000251675
Related Links
- 急性胃粘膜病変(AGML)。急性胃粘膜病変(AGML)とはどんな病気か 突然の上腹部 痛や吐血あるいは下血で発症し、緊急の内視鏡検査で胃や十二指腸に多くの急性潰瘍 、びらん、急性胃炎などが認められるものです。原因は何か さまざまな原 gooヘルス ...
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★リンクテーブル★
[★]
- ☆case84 嘔吐
- ■症例
- 32歳 男性
- 主訴:
- 現病歴:2 amにからり酔っぱらって救急部に受診。11.45 pmに気分が悪くなり2度嘔吐。嘔吐物は最初は苦く感じられ、それは食べ物と2Lのビールであった。1時間程度後に、何度か猛烈に吐き気を催した。1 amに鮮赤血を吐いた(bright red blood)。患者が言うには最初は少量だったが、2回目にはかなり多い量であった。服用薬なし。時々マリファナを吸う。タバコ1日10本、アルコール2-3 unit/week
- 既往歴:特記なし
- 家族歴:特記なし
- 生活歴:
- ・身体診断
- 酔っぱらっているように見える。口の周りに乾燥した血液の付着を認める。脈拍:102/分。(臥位(lying))血圧:134/80 mmHg。立位でも血圧の変化は認められない。心血管系、呼吸器系に異常を認めず。腹部:上腹部(心窩部)にわずかに圧痛。
- ・検査
- (血液生化学)
- 異常なし
- ■解説
- (第1パラグラフ)
- もっともな診断は、下部食道もしくは胃上部における吐血を引き起こす粘膜の裂傷である(Mallory-Weiss lesion/Mallory-Weiss tear/Mallory-Weiss laceration)。激しい嘔吐やむかつきによる機械的な外傷で生じる。本症例では、なれない大量飲酒によって生じた。
- (第2パラグラフ)
- 患者の話から出血量を見積もるのは難しい。吐血はびっくりするような出来事であり、吐血の量を多く見積もりがちである。ヘモグロ分派性状であり、急性の出血では吐血量を見積もる手がかりにならない。急性期にヘモグロ分が低ければ慢性の出血をほのめかす。著しい失血の最初のサインは頻脈と起立時の血圧低下であることがある。本症例の彼の脈波速いが、これは不安と関連しているのかもしれない。
- (第3パラグラフ)
- 吐血の他の原因は胃炎か消化性潰瘍である。何度か血液を含まない胃内容物のむかつきと嘔吐の話はマロリーワイス症候群に特徴的である。この疾患は普通介入を必要としない良性の病態である。確定診断は上部消化管内視鏡を必要とするが、典型的な症例ではいつも必要になるわけではない。時に、出血がもりひどかったり、壁の解離が粘膜より深いこともあり、穿孔につながる。
- (第4パラグラフ)
- この症例の管理は注意深い観察、嘔吐で失われた体液を戻すための静脈内輸液である。出血が激しい場合には血液型検査のために採血するが、輸血は必ずしも必要ない。彼は生徒大とH2 blockerで治療された。嘔吐は収まりそれ以上の出血も見られなかった。彼は将来のパーティでは通院しすぎないように決めた。
- ■管理(内科診断学 第2版 医学書院)
- ①本疾患の大多数は安静、絶食、制酸薬・粘膜保護薬の投与で保存的に治療できる。
- ②輸血が必要なほどの貧血は稀である。
- ③内視鏡検査時に出血している症例に対しては内視鏡的止血術を行う。
- ④クリッピング法(図4-89) [図] 、純エタノール局注法、アルゴンプラズマ凝固(APC)法などさまざまあるが、いずれの方法でも良好な止血成績を得られる。
- ■鑑別診断 (内科診断学 第2版 医学書院 p.843)
- ・特発性食道破裂(ブールハーフェ症候群)
- ・逆流性食道炎
- ・食道静脈瘤破裂
- ・出血性胃潰瘍
- ・急性胃粘膜病変(AGML)
- ■KEYPOINT
- ・吐血の前の血液を伴わない激しい嘔吐とむかつきの既往は、上部消化管の裂傷を示唆する。
- ・患者は血液の量を見積もるのが困難と分かるので、吐血で失われた失血の程度は多糸かでないし、消化管の中にとどまっている血液の量は分からない。
- ・アルコールは救急入院の約1/4と直接の連関があるという研究がある。
- □マロリーワイス症候群(内科診断学 第2版 医学書院)
- 嘔吐などにより腹腔内圧が急激に上昇して噴門部近傍に裂創が発生し、これを出血源として顕出血をきたしたもの。30-50歳代の男性に多く、全消化管出血例の約3-15%を占める。 アルコール多飲が原因となることが多いが、ほかに妊娠悪阻、乗り物酔い、脳腫瘍や髄膜炎、医原性のものとしては上部消化管内視鏡検査や心肺蘇生術など、原因となるものは種々である。 ②嘔吐などにより急激に腹圧が上昇すると、急激に胃内圧が上昇し、これにより食道胃接合部近傍に裂創が生じる。
- □吐血 hematemesis (内科診断学 第2版 医学書院)
- コーヒー残渣用の吐血 melanemesis
- 鮮血の吐血 hematoemesis
- □急性胃粘膜病変 acute gastric mucosal lesion AGML
- 急性胃炎の劇症型であり、急速に起こる腹痛(時に、吐血、下血)をきたし、潰瘍・びらん・出血が混在した病態を呈する。
- 病因はアルコール、薬物(アスピリン、ステロイド)、薬品、ストレス、食物(激辛食品など)、アニサキス、中枢神経系障害、熱傷、外科手術
- ■glossary
- inebriate
- vt. (人)を酔わせる(make drunk)。~を有頂天にする
- adj. 酔っぱらいの、大酒飲みの
- n. 酔っぱらい、大酒飲み
- pint n. (液体の単位)1パイント = 1/2クオート=(米)28.8753 inch cube = 0.473 liter = (英) 0.568 liter = 約500cc
- retch
- vi. むかつく、吐き気を催す、無理に吐こうとする
- vt. 吐く
- n. むかつく。ヒック(吐き気を催すときの音)
- lager n. ラガー(ビール)(貯蔵ビール;日本の普通のビール)
- violently adj. 激しく、猛烈に
- drunk adj. (pred)酔って。(fig)酔いしれて
- epigastrium n. 上腹部、心窩部
- blood grouping 血液型判定、血液型検査
- indulge
- vt. ~にふけらせる。気ままにさせる、(子どもを)甘やかす。(欲求などを)思いのままに満たす。喜ばせる、楽しませる。
- vi. (快楽・趣味などに)ふける、身を任す(in)。(略式)たらふく食べる、痛飲する。(~に)従事する。(好ましくないことに)かかわる(in)
- □Hematemesis and Melena(Differential Diagnosis in Primary Care 4th)
- ・吐血か喀血を見分けたい場合はnitrazine paperを使って判定
- ・身体開口部(body orifice)からの出血を鑑別するとき解剖学的なアプローチがよい。
- (食道)
- ・静脈瘤、逆流性食道炎、癌腫、マロリーワイス症候群。
- ・外来異物も忘れるな。
- ・先天性まれな病因として異所性胃粘膜によるバレット食道炎と潰瘍もある。
- ・大動脈瘤、縦隔腫瘍、肺癌が食道を潰瘍化させ出血させることもある。
- (胃)
- ・炎症:胃炎と胃潰瘍。アスピリンとアルコールも良くある原因
- ・幽門部静脈瘤で出血するかもしれない
- ・出血がひどく、他の原因が見つからなければ血液疾患を検索する。
- (診断への道)
- ・吐血の確固たる証拠がある時、内視鏡をつかえる状況にあれば問診とか検査で無駄な時間を使わずに内視鏡で診断&治療をやってしまえ。
- ・血液型検査、血液のクロスマッチ?して輸血の準備、凝固能検査など鑑別に必要な検査をやりなさい。内視鏡検査の準備をしている間に、アルコール、アスピリン、そのほかの薬品の服用、潰瘍の既往、食道疾患既往を聴け
- ・ひどい出血や最近の急な吐血の既往がなければ(内視鏡を使わずに?)伝統的なアプローチでも良い
- ・吐血の前に血液を伴わない嘔吐があればマロリーワイス症候群の診断の助けとなる。
[★]
- 英
- Mallory-Weiss syndrome
- 同
- Mallory-Weiss症候群。Mallory-Weiss裂傷? Mallory-Weiss tears? Mallory-Weiss lesion Mallory-Weiss laceration
概念
- 定義:「嘔吐などにより腹腔内圧が急激に上昇して噴門部近傍に裂創が発生し、これを出血源として顕出血をきたしたもの」
- 頻回かつ激しいの嘔吐により粘膜裂傷を生じこれにより吐血する病態。
- 胸腔内圧の上昇により食道胃接合部付近に粘膜下層までの裂創を来たす。裂創は噴門部小弯部に好発する。
- 典型的には激しい嘔吐を繰り返し、2回目以降の嘔吐で多量の新鮮血を認めることが多い。
- 嘔吐を繰り返すどんな病態もMallory-Weiss症候群の引き金となり得る。
頻度
- 30-50歳代の男性に多く、全消化管出血例の約3-15%を占める。
原因
- 嘔吐(アルコール多飲、妊娠悪阻、乗り物酔い、脳腫瘍、髄膜炎、内視鏡検査時の嘔吐反射誘発)
- 咳嗽、くしゃみ、排便、分娩後 → 腹腔内圧および胃食道内圧の上昇
症状
Mallory-Weiss症候群自体で胸痛や腹痛を伴うことは少ない。
検査
- 上部消化管内視鏡:食道から胃噴門部小弯にかけて縦走する裂創を認める(主に接合部直下の胃側に生じるが、時に接合部をまたいで食道に及ぶことがある)。小弯に次いで後壁に多い。裂創は1-2 条が多く、深さは粘膜に限局することが多い。
- 胸部レントゲン:縦隔に気腫がないことを確認
- 胸部レントゲン:縦隔に気腫がないことを確認
分類
- I群:胃限局型 → 最も多い
- II群:食道、胃併存型
- III群:食道限局型
診断
鑑別診断
- IMD.843
治療
- 保存的治療でほとんどが自然止血され、再出血することはあまりない。
- 絶食、点滴、安静、輸血、止血剤投与
- 止血困難であれば、クリッピング術を施行する。
臨床経過
国試
参考
- http://vitaminex.exblog.jp/9065112
[★]
- 英
- acute gastric mucosal lesion AGML
まとめ
- 突発する臨床症状に加え内視鏡所見で診断される疾患である。臨床症状としては急性に起こる腹痛があり、時に出血、下血を伴う。内視鏡所見としては多発性の浮腫・発赤・びらん・出血が混在して認められる。原因としては薬剤性(特にNSAID。ステロイド、抗菌薬)が多く、ストレス(手術、外傷、熱傷、出血)、アルコールがこれに次ぐ。発生機序としては粘膜の血流障害が考えられている。治療は酸分泌抑制(H2受容体拮抗薬)が用いられる。(QB.A-83 SSUR.503)
定義
- 1968年、Katzらが疾病分類学的概念として提唱
- 急性びらん性胃炎、急性胃潰瘍、出血性胃炎をまとめた病態
- 激しい症状で急激に発症し、胃および上部消化管(食道、十二指腸)にびらんなどの多彩な粘膜病変を生じ、誘因の除去によって早期に治癒する病態
- 急性胃炎の劇症型であり、急速に起こる腹痛(時に、吐血、下血)をきたし、潰瘍・びらん・出血が混在した病態を呈する。(消化器 090615 III,IV)
参考1
- 臨床検査にて胃粘膜に異常所見を認めるもの。 病理的には急性胃炎と急性胃潰瘍病変を伴うもの。 すなわち粘膜固有層のみの炎症病変と粘膜筋板を浸潤する潰瘍病変が同時に生じる。
病因
- 発症には胃粘膜の血流障害が関与するとされている。
- アルコール
- 薬物(アスピリン、ステロイド)、薬品
- ストレス
- 食物(激辛食品など)
- アニサキス
- 中枢神経系障害
- 熱傷
- 外科手術
QB.A-82
- 60%:薬剤性(約60%がNSAIDs、10%がステロイド、10%が抗菌薬)
- 15%:アルコール
- 15%:ストレス
SSUR.503
- 出血や心窩部痛などの急激な症状に対し、内視鏡検査が行われ急性びらん、急性潰瘍、あるいは出血潰瘍のいずれかが認められた場合。
治療
- (酸分泌抑制)H2受容体拮抗薬
- (腹痛)抗コリン薬
参考
- http://d.hatena.ne.jp/pebbleinsky/20091231
- http://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/p/pebbleinsky/20100116/20100116155625.jpg
- http://hkytt2004.wilbo.jp/files/2011/03/gpf2photo120041007124208.png
[★]
- 英
- acute gastritis
- ラ
- gastritis acuta
- 関
- 急性胃粘膜病変 AGML
[★]
急性胃粘膜病変 AGML