| 形状
 | 
グラム陽性菌
 | 
グラム陰性菌
 | 
| 球菌
 | 
 
 | 
スタフィロコッカス属
 | 
黄色ブドウ球菌
 | 
Staphylococcus aureus
 | 
多様
 | 
 
 | 
 
 | 
ナイセリア属
 | 
淋菌 
 | 
Neisseria gonorrhoeae
 | 
淋病
 | 
 
 | 
| ストレプトコッカス属
 | 
化膿性連鎖球菌
 | 
Streptococcus pyogenes
 | 
多様
 | 
莢膜
 | 
髄膜炎菌
 | 
Neisseria meningitidis
 | 
多様
 | 
 
 | 
| 肺炎球菌
 | 
Streptococcus pneumoniae
 | 
 
 | 
 
 | 
ベイヨネラ属
 | 
 
 | 
Veillonella
 | 
 
 | 
 
 | 
| エンテロコッカス属
 | 
(総称)腸球菌
 | 
Enterococcus faecalis
 | 
 
 | 
 
 | 
モラクセラ属/ ブランハメラ亜属
 | 
 
 | 
Moraxella catarrhalis
 | 
肺炎
 | 
 
 | 
| Enterococcus faecium
 | 
 
 | 
 
 | 
 
 | 
| 桿菌
 | 
 
 | 
バシラス属
 | 
炭疽菌
 | 
Bacillus anthracis
 | 
炭疽
 | 
好気性菌、有芽胞菌、莢膜
 | 
腸内細菌科
 | 
エンテロバクター属
 | 
 
 | 
 
 | 
肺炎、尿路感染
 | 
 
 | 
|  
 | 
セレウス菌
 | 
Bacillus cereus
 | 
細菌性食中毒
 | 
好気性菌、有芽胞菌
 | 
エシェリキア属
 | 
大腸菌
 | 
Escherichia coli
 | 
パラチフス
 | 
通性嫌気性
 | 
|  
 | 
クロストリジウム属
 | 
破傷風菌
 | 
Clostridium tetani
 | 
破傷風
 | 
嫌気性菌、有芽胞菌
 | 
クレブシエラ属
 | 
 
 | 
 
 | 
下痢、肺炎、尿路感染
 | 
 
 | 
|  
 | 
ボツリヌス菌
 | 
Clostridium botulinum
 | 
ボツリヌス中毒
 | 
プロテウス属
 | 
 
 | 
 
 | 
尿路感染
 | 
 
 | 
|  
 | 
ウェルシュ菌
 | 
Clostridium perfringens
 | 
多様
 | 
サルモネラ属
 | 
パラチフス菌
 | 
Sallmonella serovar Paratyphi
 | 
腸チフス
 | 
通性嫌気性
 | 
|  
 | 
ディフィシル菌
 | 
Clostridium difficile
 | 
多様
 | 
チフス菌
 | 
Sallmonella serovar Typhi
 | 
 
 | 
通性嫌気性
 | 
|  
 | 
 
 | 
ガス壊疸菌群
 | 
 
 | 
 
 | 
 
 | 
セラチア属
 | 
 
 | 
Serratia
 | 
日和見感染
 | 
通性嫌気性
 | 
| マイコバクテリウム科
 | 
マイコバクテリウム属
 | 
結核菌
 | 
Mycobacterium tuberculosis
 | 
結核
 | 
無芽胞菌
 | 
シゲラ属
 | 
赤痢菌
 | 
Shigella
 | 
赤痢
 | 
通性嫌気性
 | 
| ライ菌
 | 
Mycobacterium leprae
 | 
ライ病
 | 
エルシニア属
 | 
ペスト菌
 | 
Yersinia pestis
 | 
ペスト
 | 
通性嫌気性
 | 
| コリネバクテリウム科
 | 
コリネバクテリウム属
 | 
ジフテリア菌
 | 
Corynebacterium diphtheriae
 | 
ジフテリア
 | 
 
 | 
Yersinia enterocolitica
 | 
多様
 | 
通性嫌気性
 | 
| ノカルジア科
 | 
ノカルジア属
 | 
ノカルジア
 | 
 
 | 
 
 | 
ビブリオ科
 | 
ビブリオ属
 | 
コレラ菌
 | 
Vibrio cholerae
 | 
コレラ
 | 
通性嫌気性
 | 
| アクチノマイセス科
 | 
アクチノマイセス属(放線菌属)
 | 
(総称)放線菌
 | 
Actinomyces
 | 
 
 | 
腸炎ビブリオ
 | 
Vibrio parahaemolyticus
 | 
腸炎ビブリオ感染症
 | 
通性嫌気性
 | 
|  
 | 
リステリア属
 | 
 
 | 
Listeria monocytogenes
 | 
リステリア症
 | 
嫌気性菌、無芽胞菌、人獣共通感染症、通性細胞内寄生菌
 | 
パスツレラ科
 | 
ヘモフィルス属
 | 
インフルエンザ菌
 | 
Haemophilis influenzae
 | 
多様
 | 
 
 | 
|  
 | 
パスツレラ属
 | 
パスツレラ属菌
 | 
Pasteurella multocida
 | 
人獣共通感染症
 | 
 
 | 
| ストレプトバシラス属
 | 
ストレプトバシラス属菌
 | 
Streptobacillus moniliformis
 | 
鼠咬症
 | 
 
 | 
|  
 | 
シュードモナス属
 | 
緑膿菌
 | 
Psudomonas aeruginosa
 | 
緑膿菌感染症
 | 
好気性、院内感染症
 | 
| ボルデテラ属
 | 
百日咳菌
 | 
Bordetela pertussis
 | 
百日咳
 | 
好気性、短桿菌
 | 
| ブルセラ属
 | 
ブルセラ
 | 
Brucella
 | 
ブルセラ症
 | 
好気性、細胞内増殖菌、短桿菌
 | 
| フランシセラ属
 | 
野兎病菌
 | 
Francisella tularensis
 | 
野兎病
 | 
好気性、球桿菌
 | 
| レジオネラ属
 | 
 
 | 
Legionella pneumophila
 | 
ポンティアック熱/レジオネラ肺炎
 | 
好気性
 | 
| バクテロイデス属
 | 
 
 | 
Bacteroides fragilis
 | 
嫌気性感染症
 | 
偏性嫌気性菌
 | 
| らせん菌
 | 
 
 | 
スピロヘータ科
 | 
トレポネーマ属
 | 
梅毒トレポネーマ
 | 
Treponema pallidum subspecies pallidum
 | 
梅毒
 | 
 
 | 
| ボレリア属
 | 
回帰熱ボレリア
 | 
Borrelia recurrentis
 | 
回帰熱
 | 
| ライム病ボレリア
 | 
Borrelia burgdorferi
 | 
ライム病
 | 
| レプトスピラ科
 | 
レプトスピラ属
 | 
黄疸出血性レプトスピラ
 | 
Leptospira interrogans serovar icterohaemorrhagiae
 | 
黄疸出血性レプトスピラ症(レプトスピラ症、ワイル病、黄疸性ワイル病)
 | 
| ?
 | 
スピリルム
 | 
鼠咬症スピリルム
 | 
 
 | 
鼠咬症
 | 
| ?
 | 
カンピロバクター属
 | 
カンピロバクター属菌
 | 
 
 | 
カンピロバクター腸炎
 | 
| ?
 | 
ヘリコバクター属
 | 
 
 | 
Helicobacter pylori
 | 
 
 |