英: phosphodiester bond, phosphodiester linkage
同: phosphodiester結合
関: [[]]

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出典(authority):フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』「2015/09/16 15:12:45」(JST)

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DNA内のホスホジエステル結合

ホスホジエステル結合（ホスホジエステルけつごう、Phosphodiester bond）とは、炭素原子の間がリン酸を介した2つのエステル結合によって強く共有結合している結合様式のこと。地球上のすべての生命に存在し、DNAやRNAの骨格を形成している。この場合、（デオキシ）リボースの5'位の炭素原子と、他の（デオキシ）リボースの3'位の炭素原子の間を結合している。

リン酸基のpKa値は0に近いため、生体内の中性条件では負電荷をもつ。そのため二本鎖DNAでは相対するリン酸同士が反発力を示し、それがタンパク質（ヒストン）、金属イオン、そしてポリアミンによって中和されている。

ホスホジエステル結合を形成して新たなヌクレオチドを結合する際には、ヌクレオチドの三リン酸型もしくは二リン酸型が解裂することで、酵素反応を進行させるために必要なエネルギーが発生し、そのリン酸基がホスホジエステル結合を形成する。

RNAの五炭糖同士を結合しているホスホジエステル結合はアルカリ加水分解によって分解されやすい。このとき2'位の水酸基が求核剤として機能して2',3'-環状一リン酸を形成し、次いで2'-一リン酸または3'-一リン酸に分解される。DNAは2'位の水酸基がないため、同様のアルカリ条件では安定である。

ホスホジエステラーゼはホスホジエステル結合の加水分解を触媒する酵素である。DNAの酸化損傷を修復する際には3'-ホスホジエステラーゼが重要である。またサイクリックAMPやサイクリックGMPを、AMPやGMPにする。

DNA複製の際、DNAポリメラーゼが合成したDNA鎖同士は、DNAリガーゼがホスホジエステル結合を形成することでつながれる。

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Japanese Journal

18 熱水環境下でのヌクレオチドホスホジエステル結合の形成

根本淳史,小澤慶太,今井栄一,本多元,羽鳥晋由,松野孝一郎
Viva origino 32(1), 23, 2004-02-28
NAID 110003723325

ラット再生肝における8-オキソ-2'-デオキシグアノシン除去エンドヌクレアーゼ

田原正一,田口隆彦,金子孝夫 [他]
岡山大学農学部学術報告 93, 5-11, 2004-02
… て，エンドヌクレアーゼ活性を持つ修復酵素をホスホセルロースカラムによって分離して検出することを試みた．その結果，再生肝中にDNA中の8-オキソ-2’-デオキシグアノシンヌクレオシドの5’側のホスホジエステル結合を切断する活性があることが判明した．本酵素とホスホジエステラーゼを共存させると，γ-線を照射して8-オキソグアニンを豊富に含む子ウシ胸腺DNAから，8-オキソ-2’-デオキシグアノシンが放出さ …
NAID 120002311218

細菌の逆転写酵素およびmsDNAの構造と機能

島本整
日本細菌学雑誌 58(2), 441-450, 2003-05-30
… 大腸菌由来の逆転写酵素を精製し, in vitro でmsDNA合成を調べたところ, 細菌逆転写酵素は2,5-ホスホジエステル結合を形成する活性を持つ特殊な酵素であることが明らかになった。 …
NAID 130001386544

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★リンクテーブル★

リンク元	「ヌクレアーゼ」「核酸」「phosphodiester bond」「phosphodiester linkage」「phosphodiester結合」
関連記事	「結合」「エス」「ホスホ」「ジエステル」

「ヌクレアーゼ」

　　[★]

英: nuclease
同: 核酸分解酵素
関

核酸(RNA, DNA)を加水分解する酵素。核酸はホスホジエステル結合で連結しているので、核酸を分解する酵素はホスホジエステラーゼと総称される。このうち、DNAを分解する酵素はデオキシヌクレアーゼ、RNAを分解する酵素はリボヌクレアーゼと呼ばれる。

「核酸」

　　[★]

英: nucleic acid
関: ヌクレオチド

DNAとRNAを指す
ホスホジエステル結合で鎖状に連結している

「phosphodiester bond」

　　[★] ホスホジエステル結合

「phosphodiester linkage」

　　[★] ホスホジエステル結合

「phosphodiester結合」

　　[★] ホスホジエステル結合

「結合」

　　[★]

英: binding、bond、linkage、connection、conjugation、conjunction、union、bonding、engagement,; bind、associate、conjugate、combine、connect、couple、engage、join、dock、ligate、conjoin
関: 会合、関係、関与、関連、協同、共役、組み合わせ、結合性、結紮、結線、従事、接合、接合体、同僚、ドッキング、バインディング、複合物、付随、併用、抱合、抱合体、結びつける、約束、癒合、癒着、連関、連結、連合、連鎖、連接、連絡、団結、組合、参加、接続、一対、合併、組み合わせる、カップル、組合せ、絆

「エス」

　　[★]

英: id
独: Es
同: イド
関: リビドー

フリードリヒ・ニーチェが使用し、ゲオルグ・グロデック（Georg・Groddeck)の『エスとの対話』（"Gesellschaft"）などで使われた用語で、彼と交流があったジークムント・フロイトが採用した精神分析学用語ともなった。（なお、1953年にジェイムズ・ストレイチーによるフロイト翻訳全集の英訳の際、エスはイド（ラテン語）と訳されアメリカ系の精神分析学で流布された。）自我参照。(wikipedia jaより)