- 英
- isocitrate dehydrogenase
- 同
- イソクエン酸脱水素酵素
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出典(authority):フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』「2014/06/30 20:00:30」(JST)
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| イソクエン酸デヒドロゲナーゼ (NAD+) |
| 識別子 |
| EC番号 |
1.1.1.41 |
| CAS登録番号 |
9001-58-5 |
| データベース |
| IntEnz |
IntEnz view |
| BRENDA |
BRENDA entry |
| ExPASy |
NiceZyme view |
| KEGG |
KEGG entry |
| MetaCyc |
metabolic pathway |
| PRIAM |
profile |
| PDB構造 |
RCSB PDB PDBe PDBsum |
| 検索 |
| PMC |
articles |
| PubMed |
articles |
| NCBI |
proteins |
|
| イソクエン酸デヒドロゲナーゼ (NADP+) |
| 識別子 |
| EC番号 |
1.1.1.42 |
| CAS登録番号 |
9028-48-2 |
| データベース |
| IntEnz |
IntEnz view |
| BRENDA |
BRENDA entry |
| ExPASy |
NiceZyme view |
| KEGG |
KEGG entry |
| MetaCyc |
metabolic pathway |
| PRIAM |
profile |
| PDB構造 |
RCSB PDB PDBe PDBsum |
| 検索 |
| PMC |
articles |
| PubMed |
articles |
| NCBI |
proteins |
|
| イソクエン酸デヒドロゲナーゼ |
|
Found in Escherichia coli
|
| 識別子 |
| 略号 |
IDH1 |
| Entrez |
3417 |
| HUGO |
5382 |
| OMIM |
147700 |
| PDB |
1cw7 (RCSB PDB PDBe PDBj) |
| RefSeq |
NM_005896 |
| UniProt |
O75874 |
| 他のデータ |
| EC番号 |
1.1.1.42 |
| 遺伝子座 |
Chr. 2 q32-qter |
イソクエン酸デヒドロゲナーゼ(isocitrate dehydrogenase, IDH)は、イソクエン酸と2-オキソグルタル酸とを相互変換する酸化還元酵素である。イソクエン酸デヒドロゲナーゼにはイソクエン酸デヒドロゲナーゼ (NAD+)(EC 1.1.1.41)と、イソクエン酸デヒドロゲナーゼ (NADP+)(EC 1.1.1.42)の2種が存在するがクエン酸回路を構成するのは前者の方である。
クエン酸回路を構成するイソクエン酸デヒドロゲナーゼ (NAD+)は二段階でイソクエン酸から2-オキソグルタル酸に変換している。まず、イソクエン酸(二級アルコール)のオキサロコハク酸(ケトン)への酸化をしたのち、続いてこのオキサロコハク酸のβ-カルボキシル基を脱炭酸することによりα-ケトグルタル酸へ変換される。
もう一方のイソクエン酸デヒドロゲナーゼ (NADP+)も同じ反応をするが、こちらの反応はクエン酸回路とは関係がなく、ミトコンドリア、ペルオキシソームと同様に細胞質基質で行われ[1]、補因子もNAD+ではなくNADP+が使われる。
目次
- 1 エネルギー論
- 2 構造
- 3 脚注
- 4 関連項目
- 5 外部リンク
エネルギー論
どちらの酵素とも反応全体の自由エネルギーは-8.4 kJ/molである。IDHはVmax(最大反応速度)を低下させることなくイソクエン酸のKM(ミカエリス・メンテン定数 - 詳細はミカエリス・メンテン式を参照)を低下させる。
構造
NAD-IDHは、3つのサブユニットからなり、アロステリック制御され、Mg2+またはMn2+イオンを必要とする。既知の構造を持つ最も近いホモログは大腸菌のNADP依存型IDHで、2つのサブユニットと13%の相同性と29%の類似性に基づいたアミノ酸配列を持つ。既知の全てのNADP-IDHsはホモダイマーである。
脚注
- ^ Corpas FJ et al. (1999). “Peroxisomal NADP-Dependent Isocitrate Dehydrogenase. Characterization and Activity Regulation during Natural Senescence”. Plant Physiology 121 (3): 921–928.. doi:10.1104/pp.121.3.921. PMID 10557241.
関連項目
外部リンク
- KEGG Citrate cycle (TCA cycle)
- 蛋白質構造データバンク 今月の分子129:イソクエン酸脱水素酵素(Isocitrate Dehydrogenase)
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代謝: クエン酸回路の酵素 |
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| 回路 |
クエン酸シンターゼ(EC 2.3.3.1) - アコニット酸ヒドラターゼ(EC 4.2.1.3) - イソクエン酸デヒドロゲナーゼ(EC 1.1.1.41, EC 1.1.1.42) - オキソグルタル酸デヒドロゲナーゼ (スクシニル基転位)(EC 1.2.4.2) - スクシニルCoAシンターゼ(EC 6.2.1.4, EC 6.2.1.5) - コハク酸デヒドロゲナーゼ (ユビキノン)(EC 1.3.5.1, EC 1.3.99.1) - フマル酸ヒドラターゼ(EC 4.2.1.2) - リンゴ酸デヒドロゲナーゼ(EC 1.1.1.37)
|
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| 炭酸固定補充 |
ピルビン酸カルボキシラーゼ - アスパラギン酸トランスアミナーゼ - グルタミン酸デヒドロゲナーゼ - メチルマロニルCoAムターゼ - ピルビン酸デヒドロゲナーゼ複合体
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