- 英
- repetitive sequence, repeated sequence
- 同
- 繰返し配列、繰り返し配列
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出典(authority):フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』「2014/01/18 12:25:23」(JST)
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反復配列(はんぷくはいれつ)とは、生物ゲノムのDNA配列で、同じ配列が反復して(特に数回以上)見られるものの総称である。真核生物、特に進化した動植物に多く見られる。
概要[編集]
一部を除いて機能はよくわかっていないため、従来は無駄な「ジャンクDNA」あるいは「利己的遺伝子」の例とされる一方、遺伝的組換えを通じて進化に大きく関わったとも考えられてきた。最近になって、一部のものについては遺伝子の発現調節に関わっている可能性が指摘されている。
次のように大きく2種類に分けられ、さらにいくつかに分類される。
- 縦列(単純)反復配列(タンデムリピート):同じ配列が同じ向きに隣り合って存在する。
- サテライトDNA:他の部分のDNAと密度が異なることから発見されたもの。染色体の動原体にあるα-サテライトなどが知られる。配列ユニットの比較的短いものは特にミニサテライトおよびマイクロサテライトとして区別され、個体による反復回数の違いが多いのでDNA型鑑定によく利用される。
- ミニサテライト:10ないし100塩基対からなる。
- マイクロサテライト:数塩基対からなる。染色体全体に見られる。
- 散在反復配列:隣り合わず散在する配列。レトロトランスポゾンに由来すると考えられている。長さによりLINEおよびSINEに分けられ、ヒトではLINEとして「LINE-1」、SINEとして「Alu配列」と呼ばれる特定の配列が多い。
- LINE(Long INterspersed Elements:長鎖散在反復配列)蛋白質をコードする遺伝子に似た配列からなる(偽遺伝子の一種)。
- SINE(Short INterspersed Elements:短鎖散在反復配列)一般の遺伝子よりも短い。
このほか特殊なものとして、テロメアDNAや、トランスポゾンの両端にあるもの(2回だけ反復)がある。
真正細菌と古細菌は、CRISPRと呼ばれる反復配列を持つ。この配列はRNAiと類似した機構でウイルスの感染やプラスミドの侵入を抑えると考えられている。
UpToDate Contents
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- 1. 遺伝的変異の概要overview of genetic variation [show details]
…Disease-causing expansions of tandem repeat sequences (trinucleotide repeats) have been described in coding regions of genes, intronic sequences, and 5' untranslated regions (5’UTR) of sequence and are mutated in several …
- 2. 遺伝性疾患の基本原則basic principles of genetic disease [show details]
…as indels), triplet repeat expansion (eg, expansion of a short, tandemly repeated sequence of DNA, usually two to four bases in length, from a normal repeat size of 20 to 30 repeats to more than 100 or …
- 3. 双胎間輸血症候群:マネージメントと転帰twin twin transfusion syndrome management and outcome [show details]
… we offer selective fetal reduction or an attempt at repeat laser ablation. However, a repeat laser procedure can often be difficult due… Discordant values are indicative of twin anemia polycythemia sequence (TAPS),…
- 4. 手術室外で成人に迅速導入気管挿管を行う際に用いる神経筋遮断薬(NMBA)neuromuscular blocking agents nmbas for rapid sequence intubation in adults outside of the operating room [show details]
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- 5. 中枢性睡眠時無呼吸:病因central sleep apnea pathogenesis [show details]
…the apneic threshold. A central apnea can recur when sleep resumes, allowing the above sequence of events to repeat. PaCO2 stabilizes above the apneic threshold once the transition from wakefulness …
Japanese Journal
- 単純反復配列を考慮した塩基配列データの類似性検定 : スペクトル解析による特徴量の抽出
- 和歌山大学教育学部紀要. 自然科学 = Bulletin of the Faculty of Education, Wakayama University. 和歌山大学教育学部紀要委員会 編 65, 15-19, 2015-02
- NAID 120005612576
- P8-026 皮膚筋炎でフォローされていた球脊髄性筋萎縮症(SBMA)の1例
- シーラカンスゲノム中の反復配列の特徴 (特集 シーラカンス研究最前線) -- (ゲノム)
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- 真核生物のゲノムは多数の反復配列を含んでいます。これらの反復配列は大きく2つのカテゴリーに分けられます。一つは、サテライト DNA、ミニサテライトDNA、マイクロサテライトDNAなどと呼ばれる、同じ配列が同方向に連なって存在 ...
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★リンクテーブル★
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- 関
- direct repeat、inverted repeat sequence、reiterated sequence、repeat tract、repeated sequence、repetitive region
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- 英
- repetitive sequence
- 関
- 反復配列、繰り返し配列、直列反復配列、逆方向反復配列、反復領域
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- 英
- repetitive sequence、repeat tract
- 関
- 繰返し配列、反復配列
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- 関
- reiterated sequence、repetitive sequence
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- 関
- repeated sequence、repetitive sequence
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- 英
- long interspersed nucleotide element、long interspersed nuclear element、LINE
- 関
- 長い散在反復配列、長い散在性反復配列、LINE-1配列、長鎖散在反復配列、L1配列
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- 英
- long interspersed element、long interspersed nuclear element、long interspersed nucleotide element、LINE
- 関
- 長散在型反復配列、長い散在反復配列、長鎖散在反復配列
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- 英
- long interspersed nucleotide element
- 関
- 長散在型反復配列、長い散在反復配列、長い散在性反復配列
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- 英
- direct repeat
- 関
- 繰返し配列、ダイレクトリピート、逆方向反復配列、反復領域
[★]
- 英
- sequence、arrangement、array、constellation、arrange、sequential
- 関
- 協定、経時的、系列、結果、シークエンス、シーケンス、順序、準備、筋道、整列、取り計らう、配置、配列決定、連続、連続的、逐次、結果としての、時系列、並べる、アレイ、順次、整理
array_unique()
for ( $i = 0 ; $i < 5 ; $i++ ) {
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var_dump($a);
$b = array_unique($a['w']); #配列 重複キー 消去
var_dump($b);
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配列の要素の除去
array_pop
- 配列のインデックスから、末尾にあるインデックス1つを取り除く。指定した変数の配列が空だった場合には、null が帰される。
配列の結合
- 1. +演算子。同じキーを上書きする。
- 2. array_push(array, array)とすると、出力が array([0]->array, [1]->array)になる。
- 3. array_match(out_array, add_array)これでokだが、add_array = array();だとエラーが起こるので、適当なトラップが必要。 ← array_mergeの間違えでしょ?
配列要素の結合
$str = implode('/',$array);
配列の要素表示
[★]
- 英
- row、tier、train
- 関
- 作条、訓練、層、連、段
[★]
- 英
- iteration(PSY), repetition(IMD)