長い散在性反復配列

英

long interspersed element、long interspersed nuclear element、long interspersed nucleotide element、LINE

関

長散在型反復配列、長い散在反復配列、長鎖散在反復配列

UpToDate Contents

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• 1. 先天性および後天性ＱＴ延長症候群の遺伝学 genetics of congenital and acquired long qt syndrome
• 2. 正常に機能する二腔ペーシングシステムによる予期せぬ心リズム unexpected rhythms with normally functioning dual chamber pacing systems
• 3. 先天性ＱＴ延長症候群の診断 diagnosis of congenital long qt syndrome
• 4. 先天性QT延長症候群の臨床的特徴 clinical features of congenital long qt syndrome
• 5. 明らかな器質的心疾患のない患者の単形性心室頻脈 monomorphic ventricular tachycardia in the absence of apparent structural heart disease

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... の特定の場所に反復が集中する直列型と、ゲノム内に散らばる散在型がある。後者の散在型反復配列は、長い塩基配列のLINE(ラ... ブリタニカ国際大百科事典 小項目事典を追加しました。 kotobank SINEの用語の意味を解説 ホーム ...

• my_works_rep

真核生物のゲノムは多数の反復配列を含んでいます。これらの反復配列は大きく2つのカテゴリーに分けられます。一つは、サテライト DNA、ミニサテライトDNA、マイクロサテライトDNAなどと呼ばれる、同じ配列が同方向に連なって存在 ...

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★リンクテーブル★

リンク元	「LINE」「long interspersed nucleotide element」「長散在型反復配列」「長鎖散在反復配列」
関連記事	「配列」「散在」「散在性」「反復配列」「列」

「LINE」

　　[★]

日

長い散在反復配列、長散在型反復配列、長い散在性反復配列、ライン、広範囲散在反復配列

英

long interspersed nuclear element, long interspersed nucleotide element, long interspersed element, long interspersed repetitive elements, LINEs, long interspersed repeat sequences

関

レトロトランスポゾン

quoted from http://en.wikipedia.org/wiki/Long_interspersed_nucleotide_elements#LINEs

• Long interspersed nuclear elements[8] are a group of genetic elements that are found in large numbers in eukaryotic genomes. They are transcribed (or are the evolutionary remains of what was once transcribed) to an RNA using an RNA polymerase II promoter that resides inside the LINE. LINEs code for the enzyme reverse transcriptase, and many LINEs also code for an endonuclease (e.g. RNase H). The reverse transcriptase has a higher specificity for the LINE RNA than other RNA, and makes a DNA copy of the RNA that can be integrated into the genome at a new site.

• The 5' UTR contains the promoter sequence, while the 3' UTR contains a polyadenylation signal (AATAAA) and a poly-A tail.[10] Because LINEs move by copying themselves (instead of moving, like transposons do), they enlarge the genome. The human genome, for example, contains about 20,000-40,000 LINEs, which is roughly 21% of the genome.

「long interspersed nucleotide element」

　　[★]

• 長鎖散在反復配列、長散在型反復配列、長い散在反復配列、長い散在性反復配列

関

L1 element、LINE、LINE-1 element、long interspersed element、long interspersed nuclear element

「長散在型反復配列」

　　[★]

英

long interspersed nucleotide element、long interspersed nuclear element、LINE

関

長い散在反復配列、長い散在性反復配列、LINE-1配列、長鎖散在反復配列、L1配列

「長鎖散在反復配列」

　　[★]

英

long interspersed nucleotide element

関

長散在型反復配列、長い散在反復配列、長い散在性反復配列

「配列」

　　[★]

英

sequence、arrangement、array、constellation、arrange、sequential

関

協定、経時的、系列、結果、シークエンス、シーケンス、順序、準備、筋道、整列、取り計らう、配置、配列決定、連続、連続的、逐次、結果としての、時系列、並べる、アレイ、順次、整理

PHP関数

array_unique()

	for ( $i = 0 ; $i < 5 ; $i++ ) {
		$a['w'][$i] = $i+100;
		$a['m'][$i] = 1;
	}
	for ( $i = 5 ; $i < 15 ; $i++ ) {
		$a['w'][$i] = $i+100;
		$a['m'][$i] = 2;
	}
	for ( $i = 15 ; $i < 20 ; $i++ ) {
		$a['w'][$i] = $i+100;
		$a['m'][$i] = 3;
	}

	$a['w'][5]=100;
	$a['w'][15]=100;

var_dump($a);
	$b = array_unique($a['w']); #配列 重複キー 消去

var_dump($b);

-----
array(2) { 
	["w"]=> array(20) 
		{
			[0]=> int(100) [1]=> int(101) [2]=> int(102) [3]=> int(103) [4]=> int(104) [5]=> int(100) [6]=> int(106) [7]=> int(107) [8]=> int(108) [9]=> int(109) [10]=> int(110) [11]=> int(111) [12]=> int(112) [13]=> int(113) [14]=> int(114) [15]=> int(100) [16]=> int(116) [17]=> int(117) [18]=> int(118) [19]=> int(119) } 
	["m"]=> array(20) 
		{
			[0]=> int(1) [1]=> int(1) [2]=> int(1) [3]=> int(1) [4]=> int(1) [5]=> int(2) [6]=> int(2) [7]=> int(2) [8]=> int(2) [9]=> int(2) [10]=> int(2) [11]=> int(2) [12]=> int(2) [13]=> int(2) [14]=> int(2) [15]=> int(3) [16]=> int(3) [17]=> int(3) [18]=> int(3) [19]=> int(3) } } 

array(18) {
			[0]=> int(100) [1]=> int(101) [2]=> int(102) [3]=> int(103) [4]=> int(104) [6]=> int(106) [7]=> int(107) [8]=> int(108) [9]=> int(109) [10]=> int(110) [11]=> int(111) [12]=> int(112) [13]=> int(113) [14]=> int(114) [16]=> int(116) [17]=> int(117) [18]=> int(118) [19]=> int(119) } 

配列の要素の除去

array_pop

• 配列のインデックスから、末尾にあるインデックス１つを取り除く。指定した変数の配列が空だった場合には、null が帰される。

配列の結合

• 1. +演算子。同じキーを上書きする。
• 2. array_push(array, array)とすると、出力が array([0]->array, [1]->array)になる。
• 3. array_match(out_array, add_array)これでokだが、add_array = array();だとエラーが起こるので、適当なトラップが必要。　←　array_mergeの間違えでしょ？

配列要素の結合

• implodeを用いる

$str = implode('/',$array);

配列の要素表示

• var_dump()
• print_r();

「散在」

　　[★]

英

dissemination、disseminate、intersperse、dispersed、interspersed

関

散らばった、転移、播種、汎発、分散、分散型、内転移

「散在性」

　　[★]

英

diffuse、disseminated、diffusely

関

拡散、拡散性、広汎性、播種性、汎発性、びまん性、瀰漫性

「反復配列」

　　[★]

英

repetitive sequence, repeated sequence

同

繰返し配列、繰り返し配列

「列」

　　[★]

英

row、tier、train

関

作条、訓練、層、連、段