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出典(authority):フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』「2013/04/17 10:21:37」(JST)

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ジエチルピロカーボネート

IUPAC名	diethyl dicarbonate
別名	ピロ炭酸ジエチル
分子式	C₆H₁₀O₅
分子量	162.141
CAS登録番号	[1609-47-8]

ジエチルピロカーボネート（Diethylpyrocarbonate; DEPC）は分子生物学の実験において、RNAを分解する酵素である RNase を失活させるために使う試薬である。RNase を失活させた DEPC 処理水は、研究室において RNA を扱う際に、分解のリスクを避けるために良く用いられる。

この作用は、DEPC が RNase のヒスチジン残基に対して共有結合修飾を行うことによる。そのため、同様に修飾のターゲットとなるTrisやHEPESバッファには DEPC は使えない。PBS、MOPS には使用可能である。簡単な法則として、反応性のある -O:、-N:、-S: といった残基を持つ酵素や化学物質に対しては、DEPC で RNase フリー処理を行うことはできない。

水に含まれる RNase を失活させるには、まず水に対して0.1％量の DEPC を添加し、37℃で一時間以上反応させる。その後121℃のオートクレーブで15分以上処理し、未反応の DEPC を不活性化させる。この方法で DEPC を不活性化（分解）した場合、水・二酸化炭素・エタノールが生じる。DEPC の濃度を上げればより多くの RNase を失活させることができるが、DEPC や分解時の副生成物が残ってしまうと、in vitro 翻訳などその後の実験操作に悪影響を及ぼす。また RNA 自体もカルボキシメチル化などの修飾を受けて有効量が低下してしまうことがあり、これはバッファ交換を行っても回復しない。

DEPC によるヒスチジンの誘導体化は、酵素におけるヒスチジン残基の重要性を確認する目的でも使われる。DEPC によるヒスチジン修飾は、イミダゾール環の窒素に対するエトキシカルボニル化である。この修飾は可逆的であり、中性条件下において0.5Mのヒドロキシルアミンで処理すると戻すことができる。

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English Journal

Molecular characterisation and the light-dark regulation of carotenoid biosynthesis in sprouts of tartary buckwheat (Fagopyrum tataricum Gaertn.).

Tuan PA, Thwe AA, Kim JK, Kim YB, Lee S, Park SU.SourceDepartment of Crop Science, Chungnam National University, 99 Daehak-ro, Yuseong-Gu, Daejeon 305-764, South Korea.
Food chemistry.Food Chem.2013 Dec 15;141(4):3803-12. doi: 10.1016/j.foodchem.2013.06.085. Epub 2013 Jun 28.
Seven partial-length cDNAs and 1 full-length cDNA that were involved in carotenoid biosynthesis and 2 partial-length cDNAs that encoded carotenoid cleavage dioxygenases were first isolated and characterised in 2 tartary buckwheat cultivars (Fagopyrum tataricum Gaertn.), Hokkai T8 and Hokkai T10. The
PMID 23993552

Identification of myb genes in Euplotes aediculatus may indicate an early evolutionary process.

Lv J, Yang T, Yang H, Li Z, Qin P, Zhang X, Liang X, Li J, Chen Q.SourceState Key Laboratory of Bio-membrane and Membrane Biotechnology, Institute of Zoology, Chinese Academy of Sciences, No. 1 West Beichen Road, Chaoyang District, Beijing 100101, China. Electronic address: ljh183@sohu.com.
Gene.Gene.2013 Nov 10;530(2):266-72. doi: 10.1016/j.gene.2013.06.072. Epub 2013 Jul 10.
The myb gene family encodes proteins characterized by a highly conserved DNA-binding domain and functions as transcription regulators. There are three myb genes in animals with three Myb-motif repeats, namely c-myb, A-myb, and B-myb. By contrast, plants possess an abundance of myb genes, the majorit
PMID 23850579

Identification and expression pattern analysis of Piwi genes during the spermiogenesis of Portunus trituberculatus.

Xiang DF, Zhu JQ, Hou CC, Yang WX.SourceThe Sperm Laboratory, College of Life Sciences, Zhejiang University, Hangzhou, Zhejiang 310058, China; School of Marine Sciences, Ningbo University, Ningbo, Zhejiang 315211, China.
Gene.Gene.2013 Nov 5. pii: S0378-1119(13)01459-5. doi: 10.1016/j.gene.2013.10.050. [Epub ahead of print]
The Piwi genes have an important role in stem cell development, gametogenesis and RNA interference in diverse organisms. So far, most of the studies have focused on the function of Piwis in vertebrates, but their function during spermiogenesis in invertebrates still remains largely unclear. In order
PMID 24211384

Japanese Journal

Raman spectroscopic measurements on DEPC liposome : phase transition observation under Xe-gas pressure

Uchida Tsutomu,Sum Amadeu K.
低温科学 71, 105-110, 2013-03-31
… Raman spectroscopic analysis was applied to observe the phase transition of dielaidoylphosphatidylcholine (DEPC) liposome under 0.5 MPa Xe pressurization conditions. … After the band assignments on DEPC molecule, detailed measurements of the methylene C-H stretching mode spectra were performed. …
NAID 120005228438

Characterization of Heme-Coordinating Histidyl Residues of an Engineered Six-Coordinated Myoglobin Mutant Based on the Reactivity with Diethylpyrocarbonate, Mass Spectrometry, and Electron Paramagnetic Resonance Spectroscopy(ENZYMOLOGY, PROTEIN ENGINEERING, AND ENZYME TECHNOLOGY)

Nakanishi Nobuyuki,Takeuchi Fusako,Park Sam-Yong [他],Hori Hiroshi,Kiyota Kohei,Uno Tadayuki,Tsubaki Motonari
Journal of bioscience and bioengineering 105(6), 604-613, 2008-06-25
… We further investigated the reactivity of these possible His ligands with diethylpyrocarbonate(DEPC) to clarify the coordination structure and their protonation states in ferric form. … We found that the non-axial His residues were easily modified with a low concentration of DEPC based on UV spectral changes and MALDI-TOF-MS analyses. …
NAID 110006792536

The Extracellular pH Dependency of Transport Activity by Human Oligopeptide Transporter 1 (hPEPT1) Expressed Stably in Chinese Hamster Ovary (CHO) Cells : A Reason for the Bell-Shaped Activity versus pH(Biopharmacy)

Fujisawa Yuki,Tateoka Ryoko,Nara Toshifumi [他],KAMO Naoki,TAIRA Takahiro,MIYAUCHI Seiji
Biological & pharmaceutical bulletin 29(5), 997-1005, 2006-05-01
… Modification of carboxyl groups or hydroxyl groups had no significant influence on the pH-profile, whereas a chemical modification of histidine residue with diethylpyrocarbonate (DEPC) completely abolished the transport activity in CHO/hPEPT1 cells. … The pH-profile of the transport activity in CHO/hPEPT1 cells treated with DEPC in the presence of 10 mM Gly-Sar also showed a bell-shape similar to that in non-treated CHO/hPEPT1 cells. …
NAID 110005602229

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