サーマス・サーモフィラス、高度好熱菌
- 関
- extreme thermophile、T. thermophilus
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出典(authority):フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』「2016/06/14 14:55:41」(JST)
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サーマス・サーモフィルス |
分類 |
ドメ
イン |
: |
細菌 Bacteria |
門 |
: |
デイノコッカス-サーマス門 Deinococcus-Thermus |
綱 |
: |
デイノコッカス綱
Deinococci |
目 |
: |
サーマス目
Thermales |
科 |
: |
サーマス科
Thermaceae |
属 |
: |
サーマス属
Thermus |
種 |
: |
T. サーモフィルス
T. thermophilus |
|
学名 |
Thermus thermophilus
(ex Oshima and Imahori 1974) Manaia et al. 1995 |
サーマス・サーモフィルス(Thermus thermophilus)はグラム陰性の好気性真正細菌である。約75℃に至適生育温度をもち、高度好熱菌に分類される。また、遺伝子操作系が確立されているなどバイオテクノロジーにも応用範囲が広く、遺伝情報学やシステム生物学のモデル生物になっている。サーマス・サーモフィルスの株の中ではHB8株とHB27株が最も有名で、双方とも2004年にゲノムの全塩基配列の解読が完了している。サーマス・サーモフィルスは日本の伊豆の峰温泉にある噴気孔から最初に発見・単離された。
外部リンク
- サーマス・サーモフィルス HB27株 ゲノム (英語)
- サーマス・サーモフィルス HB8株 ゲノム (英語)
- 高度好熱菌 (サーマス・サーモフィルス HB8株) 丸ごと一匹プロジェクト
- 高度好熱菌 (サーマス・サーモフィルス HB8株) 丸ごと一匹プロジェクトデータベース
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Thermus thermophilus |
Scientific classification |
Kingdom: |
Bacteria |
Phylum: |
Deinococcus-Thermus |
Class: |
Deinococci |
Order: |
Thermales |
Family: |
Thermaceae |
Genus: |
Thermus |
Species: |
T. thermophilus |
Binomial name |
Thermus thermophilus
|
Thermus thermophilus is a Gram negative eubacterium used in a range of biotechnological applications, including as a model organism for genetic manipulation, structural genomics, and systems biology. The bacterium is extremely thermophilic, with an optimal growth temperature of about 65 °C (149 °F). Thermus thermophilus was originally isolated from a thermal vent within a hot spring in Izu, Japan by Tairo Oshima and Kazutomo Imahori.[1] The organism has also been found to be important in the degradation of organic materials in the thermogenic phase of composting.[2] T. thermophilus is classified into several strains, of which HB8 and HB27 are the most commonly used in laboratory environments. Genome analyses of these strains were independently completed in 2004.[3]
Biotechnological applications of Thermus thermophilus enzymes
- rTth DNA polymerase is a recombinant thermostable DNA polymerase derived from Thermus thermophilus, with optimal activity at 70-80 °C, used in some PCR applications. The enzyme possesses efficient reverse transcriptase activity in the presence of manganese.
External links
- Thermus thermophilus HB27 genome page.
- Thermus thermophilus HB8 genome page.
- Structural-biological whole cell project of Thermus thermophilus HB8.
- Isolation of Thermus strains from hot composts (60ºC-80ºC)
- Whole Cell Project of Thermus thermophilus HB8: Database
References
- ^ Oshima & Imahori, K. (1974). "Description of Thermus thermophilus (Yoshida and Oshima) comb. nov., a nonsporulating thermophilic bacterium from Japanese thermal spa.". Int J Syst Bacteriol 24: 102–112. doi:10.1099/00207713-24-1-102.
- ^ Beffa, T; Blanc, M; Lyon, PF; Vogt, G; Marchiani, M; Fischer, JL; et al. (1996). "Isolation of Thermus strains from hot composts (60ºC-80ºC)". Appl. Environ. Microbiol. 62 (5): 1723–1727. PMC 167946. PMID 8633870.
- ^ Henne A; et al. (May 2004). "The genome sequence of the extreme thermophile Thermus thermophilus". Nat Biotechnol 22 (5): 547–53. doi:10.1038/nbt956. PMID 15064768.
Extremophiles
|
|
Types |
- Acidophile
- Alkaliphile
- Capnophile
- Cryozoa
- Endolith
- Halophile
- Hypolith
- Lipophile
- Lithoautotroph
- Lithophile
- Methanogen
- Metallotolerant
- Oligotroph
- Osmophile
- Piezophile
- Polyextremophile
- Psammophile
- Psychrophile
- Radioresistant
- Thermophile / Hyperthermophile
- Thermoacidophile
- Xerophile
|
|
Notable
extremophiles |
Bacteria
|
- Chloroflexus aurantiacus
- Deinococcus radiodurans
- Deinococcus–Thermus
- Snottite
- Thermus aquaticus
- Thermus thermophilus
- Spirochaeta americana
- GFAJ-1
|
|
Archaea
|
- Pyrococcus furiosus
- Strain 121
- Pyrolobus fumarii
|
|
Animalia
|
- Paralvinella sulfincola
- Halicephalobus mephisto
- Pompeii worm
- Tardigrada
|
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|
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- Halobacteria
- Halobacterium
- Helaeomyia petrolei
- Hydrothermal vent
- Methanopyrus
- Movile Cave
- Radiotrophic fungus
- Rio Tinto
- Taq polymerase
- Thermostability
- Thermotogae
|
|
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Japanese Journal
- Directed Evolution for Thermostabilization of a Hygromycin B Phosphotransferase from Streptomyces hygroscopicus
- SUGIMOTO Naohisa,TAKAKURA Yasuaki,SHIRAKI Kentaro [他]
- Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 77(11), 2234-2241, 2013-11
- NAID 40019898172
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