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出典(authority):フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』「2012/04/07 14:22:35」(JST)
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ゲルシフトアッセイとは特定の塩基配列をもつ核酸断片とタンパク質の結合を調べる実験系。転写因子の結合配列の解析に広く用いられる。EMSA (Electrophoresis Mobility Shift Assay) とも呼ばれる。
原理は核酸断片にタンパク質が結合すると核酸断片のみの場合よりも総体として分子量が大きくなるということで、この結果電気泳動で遅く流れること(移動度 mobility の違い)を利用して可視化する。
具体的な例としては、リンの放射性同位体でDNA断片を標識し、タンパク質と混合したのち、ポリアクリルアミドゲルで展開し、オートラジオグラフィーによって分析する。遊離しているDNA断片は早く流れるため下部にくるが、タンパク質が結合した断片はゆっくり流れるために上部にバンドとしてあらわれる。
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Japanese Journal
- ヒトa 1 鎖I 型コラーゲン遺伝子の転写調節─プロモーター領域の欠失解析と転写増強領域のDNA結合因子の解析─
- 吉田 隆洋
- Dokkyo journal of medical sciences 36(1), T63-T69, 2009-03-25
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- 骨シアロタンパク質(BSP)の転写調節に対するCO_2レーザーの効果
- 佐々木 庸子,荒木 正大,目澤 優,WANG Zhitao,金子 博寿,小方 頼昌
- 日本歯周病学会会誌 50(3), 176-184, 2008-09-28
- … ゲルシフトアッセイの結果, CO2レーザー照射後に経時的に抽出した核内タンパク質と, 逆方向のCCAAT配列との結合に変化は認められなかったが, 3-FREとHOX配列と核内タンパク質との結合は, 経時的に減少した。 …
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ゲルシフトアッセイ、ゲルシフト法、ゲルシフト解析
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