英: [[]]
同: prolineracemase
関: [[]]

同: prolineracemase

Wikipedia preview

出典(authority):フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』「2017/10/05 12:50:18」(JST)

wiki ja

プロリンラセマーゼ(Proline racemase、EC 5.1.1.4)は、以下の化学反応を触媒する酵素である。

L-プロリン

\rightleftharpoons

D-プロリン

従って、基質はL-プロリンまたはD-プロリン、生成物はD-プロリンまたはL-プロリンである。

系統名はプロリンラセマーゼである。この酵素は、アルギニン及びプロリンの代謝に関与している。また、細菌においては、L-プロリンとD-プロリンの相互変換を触媒している^[1]。

種の分布

最初に同定された真核生物のプロリンラセマーゼは、クルーズトリパノソーマ(Trypanosoma cruzi)のものであり、Q9NCP4として登録された。この寄生虫の酵素TcPRACは、補因子を必要としないプロリンラセマーゼで、T. cruziが感染してこの酵素が放出されると、B細胞を細胞分裂させ、寄生虫が逃げるのを助けた^[2]^[3]。

医学上及び獣医学上で重要なプロリンラセマーゼには、Clostridium difficileのQ17ZY4^[4]やTrypanosoma vivaxのB8LFE4がある^[5]。

構造

プロリンラセマーゼの生化学機構は、1960年代にCardinaleとAbelesにより^[6]、Clostridium sticklandiiのCsPRACを用いて研究が進められた。2006年には、TcPRACを競合阻害剤として知られていたピロールカルボン酸とともに共結晶化して構造を解いたBuschiazzo、Goytiaらにより修正された^[7]。これらの研究により、酵素は2つの触媒ポケットを持つことが示された。その後、等温滴定型熱量計により、溶液中でピロールカルボン酸2分子がTcPRACと結合し、恐らくは負の協同性の機構のためこの結合が時間依存であることが示された。さらに生化学上の新しい知見も、単量体に活性部位が2つあることと合致し、それまでの単量体当たり1つの活性部位という見方に変更を迫った^[8]。

出典

^ Fisher LM, Albery WJ, Knowles JR (May 1986). “Energetics of proline racemase: racemization of unlabeled proline in the unsaturated, saturated, and oversaturated regimes”. Biochemistry 25 (9): 2529-37. doi:10.1021/bi00357a037. PMID 3755058.
^ Reina-San-Martin B, Degrave W, Rougeot C, Cosson A, Chamond N, Cordeiro-Da-Silva A, Arala-Chaves M, Coutinho A, Minoprio P (August 2000). “A B-cell mitogen from a pathogenic trypanosome is a eukaryotic proline racemase”. Nat. Med. 6 (8): 890-7. doi:10.1038/78651. PMID 10932226.
^ Chamond N, Goytia M, Coatnoan N, Barale JC, Cosson A, Degrave WM, Minoprio P (October 2005). “Trypanosoma cruzi proline racemases are involved in parasite differentiation and infectivity”. Mol. Microbiol. 58 (1): 46-60. doi:10.1111/j.1365-2958.2005.04808.x. PMID 16164548.
^ Goytia M, Chamond N, Cosson A, Coatnoan N, Hermant D, Berneman A, Minoprio P (2007). “Molecular and structural discrimination of proline racemase and hydroxyproline-2-epimerase from nosocomial and bacterial pathogens”. PLoS ONE 2 (9): e885. doi:10.1371/journal.pone.0000885. PMC 1964878. PMID 17849014.
^ Chamond N, Cosson A, Coatnoan N, Minoprio P (June 2009). “Proline racemases are conserved mitogens: characterization of a Trypanosoma vivax proline racemase”. Mol. Biochem. Parasitol. 165 (2): 170-9. doi:10.1016/j.molbiopara.2009.02.002. PMID 19428664.
^ Cardinale GJ, Abeles RH (November 1968). “Purification and mechanism of action of proline racemase”. Biochemistry 7 (11): 3970-8. doi:10.1021/bi00851a026. PMID 5722267.
^ PDB 1W61 and PDB 1W62; Buschiazzo A, Goytia M, Schaeffer F, Degrave W, Shepard W, Gregoire C, Chamond N, Cosson A, Berneman A, Coatnoan N, Alzari PM, Minoprio P (February 2006). “Crystal structure, catalytic mechanism, and mitogenic properties of Trypanosoma cruzi proline racemase”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (6): 1705-10. doi:10.1073/pnas.0509010103. PMC 1413642. PMID 16446443.
^ Albery WJ, Knowled JR (May 1986). “Energetics and mechanism of proline racemase”. Biochemistry 25 (9): 2572-7. doi:10.1021/bi00357a043. PMID 3718964.

Japanese Journal

ピリドキサールリン酸非依存性プロリンラセマーゼの反応機構

ビタミン 84(5・6), 257-260, 2010-06-25
NAID 110007657770

Clostridium sicklandi由来のプロリンラセマーゼ遺伝子の単離と大腸菌での発現,及びD-プロリンの製造 : 微生物

日本農藝化學會誌 70(臨時増刊), 119, 1996-03-05
NAID 110002796378

Related Pictures

AKB48劇場:NMB48★3897

★リンクテーブル★

関連記事	「リン」「プロリン」「プロ」「ラセマーゼ」

「リン」

検索
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

proline racemase
識別子
EC番号	5.1.1.4
CAS登録番号	9024-09-3
データベース
IntEnz	IntEnz view
BRENDA（英語版）	BRENDA entry
ExPASy	NiceZyme view
KEGG	KEGG entry
MetaCyc	metabolic pathway
PRIAM	profile
PDB構造	RCSB PDB PDBe PDBsum
遺伝子オントロジー	AmiGO / EGO
検索
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

　　[★]

英: phosphorus P
関: serum phosphorus level

分子量

30.973762 u (wikipedia)
単体で化合物としてはP4、淡黄色を帯びた半透明の固体、所謂黄リンで毒性が高い。分子量124.08。

基準値

血清中のリンおよびリン化合物(リン酸イオンなどとして存在)を無機リン(P)として定量した値。

(serum)phosphorus, inorganic 2.5–4.3 mg/dL(HIM.Appendix)
2.5-4.5 mg/dL (QB)

代謝

リンは経口的に摂取され、小腸から吸収され、細胞内に取り込まれる。
骨形成とともに骨に取り込まれる。
腎より排泄される。

尿細管での分泌・再吸収

近位尿細管	70%
遠位尿細管	20%

排泄：10%

尿細管における再吸収の調節要素

臨床検査

無機リンとして定量される。

血清や尿(蓄尿)で定量される。

基準範囲

血清

基準範囲：2.5-4.5mg/dL

小児：4-7mg/dL
閉経後女性は一般集団より0.3mg/dL高値となる

尿

基準範囲：1g/日

測定値に影響を与える要因

食事。食前に測定するのが好ましい。

臨床関連

参考

1. wikiepdia

http://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%83%AA%E3%83%B3

「プロリン」

　　[★]

英: proline Pro P
同: ピロリジン-2-カルボン酸 pyrrolidine-2-carboxylic acid
関: アミノ酸

「プロ」

　　[★]

英: pro

パーセントを表す独語Prozentの略

「ラセマーゼ」

　　[★]

英: [[]]
同: racemase
関: [[]]

同: racemase

[pmid3755058-1] Fisher LM, Albery WJ, Knowles JR (May 1986). “Energetics of proline racemase: racemization of unlabeled proline in the unsaturated, saturated, and oversaturated regimes”. Biochemistry 25 (9): 2529-37. doi:10.1021/bi00357a037. PMID 3755058.

[pmid10932226-2] Reina-San-Martin B, Degrave W, Rougeot C, Cosson A, Chamond N, Cordeiro-Da-Silva A, Arala-Chaves M, Coutinho A, Minoprio P (August 2000). “A B-cell mitogen from a pathogenic trypanosome is a eukaryotic proline racemase”. Nat. Med. 6 (8): 890-7. doi:10.1038/78651. PMID 10932226.

[pmid16164548-3] Chamond N, Goytia M, Coatnoan N, Barale JC, Cosson A, Degrave WM, Minoprio P (October 2005). “Trypanosoma cruzi proline racemases are involved in parasite differentiation and infectivity”. Mol. Microbiol. 58 (1): 46-60. doi:10.1111/j.1365-2958.2005.04808.x. PMID 16164548.

[pmid17849014-4] Goytia M, Chamond N, Cosson A, Coatnoan N, Hermant D, Berneman A, Minoprio P (2007). “Molecular and structural discrimination of proline racemase and hydroxyproline-2-epimerase from nosocomial and bacterial pathogens”. PLoS ONE 2 (9): e885. doi:10.1371/journal.pone.0000885. PMC 1964878. PMID 17849014.

[pmid19428664-5] Chamond N, Cosson A, Coatnoan N, Minoprio P (June 2009). “Proline racemases are conserved mitogens: characterization of a Trypanosoma vivax proline racemase”. Mol. Biochem. Parasitol. 165 (2): 170-9. doi:10.1016/j.molbiopara.2009.02.002. PMID 19428664.

[pmid5722267-6] Cardinale GJ, Abeles RH (November 1968). “Purification and mechanism of action of proline racemase”. Biochemistry 7 (11): 3970-8. doi:10.1021/bi00851a026. PMID 5722267.

[pmid16446443-7] PDB 1W61 and PDB 1W62; Buschiazzo A, Goytia M, Schaeffer F, Degrave W, Shepard W, Gregoire C, Chamond N, Cosson A, Berneman A, Coatnoan N, Alzari PM, Minoprio P (February 2006). “Crystal structure, catalytic mechanism, and mitogenic properties of Trypanosoma cruzi proline racemase”. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (6): 1705-10. doi:10.1073/pnas.0509010103. PMC 1413642. PMID 16446443.

[pmid3718964-8] Albery WJ, Knowled JR (May 1986). “Energetics and mechanism of proline racemase”. Biochemistry 25 (9): 2572-7. doi:10.1021/bi00357a043. PMID 3718964.

匿名

検索

案内

案内

プロリンラセマーゼ