抗生物質G418、ジェネテシン
- 関
- antibiotic G418、Geneticin
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G418 |
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IUPAC名
(2R,3S,4R,5R,6S)-5-amino-6-[(1R,2S,3S,4R,6S)-4,6-diamino-3-[(2R,3R,4R,5R)-
3,5-dihydroxy-5-methyl-4-methylaminooxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxy-
2-(1-hydroxyethyl)oxane-3,4-diol
|
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識別情報 |
CAS登録番号 |
49863-47-0 |
PubChem |
123865 |
MeSH |
G 418 antibiotic G 418 |
- C[C@H]([C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H](O1)O[C@@H]2[C@H](C[C@H]([C@@H]([C @H]2O)O[C@@H]3[C@@H]([C@H]([C@@](CO3)(C)O)NC)O)N)N)N)O)O)O
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- InChI=InChI=1/C20H40N4O10/c1-6(25)14-11(27)10(26)9(23)18(32-14)33-15-7(21)4-8( 22)16(12(15)28)34-19-13(29)17(24-3)20(2,30)5-31-19/h6-19,24-30H,4-5,21-2 3H2,1-3H3/t6-,7+,8-,9-,10-,11+,12+,13-,14-,15-,16+,17-,18-,19-,20+/m1/s1
|
特性 |
化学式 |
C20H40N4O10 |
モル質量 |
496.5 |
外観 |
白色粉末 |
融点 |
138-144°C[1]
|
酸解離定数 pKa |
8.0[1] |
危険性 |
EU分類 |
Xn |
Rフレーズ |
R42/43 R61 |
Sフレーズ |
S24/25 |
特記なき場合、データは常温 (25 °C)・常圧 (100 kPa) におけるものである。 |
G418はゲンタマイシンに類似した構造のアミノグリコシド系抗生物質である。主に研究目的で、真核生物に対して遺伝子操作を行った細胞を選択するために用いられ、治療には使われない。硫酸塩として流通しておりジェネティシン(geneticin)と呼ばれることも多いが、これはライフテクノロジーズ社の登録商標である。
由来
1974年シェリング(現・シェリング・プラウ)社の研究チームによって、放線菌Micromonospora rhodorangea NRRL 5326株から単離された。 [1] [2] シェリング社は抗寄生虫薬としての利用を想定して研究を進めていたが、 [3] 化学療法剤として実用化されることはなかった。
作用機序
G418はタンパク質合成のうち伸長反応を阻害する。 通常のアミノグリコシド系抗生物質が真正細菌の70Sリボソームによるタンパク質合成を阻害するのに対して、G418は真核生物の80Sリボソームによるタンパク質合成も阻害する。 [4] 同様に80Sを阻害するアミノグリコシド系抗生物質としてハイグロマイシンBがある。
利用法
真核細胞を形質転換する際に、選択薬剤として用いられる。 [5] [6] 選択マーカー遺伝子はトランスポゾン由来のneor遺伝子を用い、 この遺伝子によりアミノグリコシドリン酸転移酵素(APH)が発現することでG418耐性となる。
一般的には、細菌や藻類に対しては5 μg/mL以下、哺乳類細胞に対しては400 μg/mLの濃度で用いられる。しかし至適濃度は細胞株や耐性遺伝子を運ぶプラスミドの種類に依存するため、実験系ごとに用量を決める必要がある。
参考文献
- ^ a b c Wagman, G.H. et al. (1974). "Antibiotic G-418, a new Micromonospora-produced aminoglycoside with activity against protozoa and helminths: fermentation, isolation, and preliminary characterization". Antimicrob. Agents Chemother. 6 (2): 144–149. PMID 15828184.
- ^ アメリカ合衆国特許第3,997,403号
- ^ Loebenberg, D. et al. (1975). "Antibiotic G418, a new Micromonospora-produced aminoglycoside with activity against protozoa and helminths: antiparasitic activity". Antimicrob. Agents Chemother. 7 (6): 811–815. PMID 1155922.
- ^ Bar-Nun, S. et al. (1983). "G-418, an elongation inhibitor of 80 S ribosomes". Biochim. Biophys. Acta. 741 (1): 123–127. doi:10.1016/0167-4781(83)90018-0. PMID 6193810.
- ^ Davies, J. and Jimenez, A (1980). "A new selective agent for eukaryotic cloning vectors". Am. J. Trop. Med. Hyg. 29 (5 Suppl): 1089–1092. PMID 7001938.
- ^ Hadfield, C. et al. (1990). "G418-resistance as a dominant marker and reporter for gene expression in Saccharomyces cerevisiae". Curr. Genet. 18: 303–313. PMID 2174744.
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G418
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Names |
IUPAC name
(2R,3S,4R,5R,6S)-5-Amino-6-[(1R,2S,3S,4R,6S)-4,6-diamino-3-[(2R,3R,4R,5R)-3,5-dihydroxy-5-methyl-4-methylaminooxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxy- 2-(1-hydroxyethyl)oxane-3,4-diol
|
Other names
Geneticin
O-2-Amino-2,7-didesoxy-D-glycero-α-D-gluco-heptopyranosyl-(1→4)-O-(3-desoxy-4-C-methyl-3-(methylamino)-β-L-arabinopyranosyl- (1→6))-D-streptamin
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Identifiers |
CAS Registry Number
|
49863-47-0 N |
ChEMBL |
ChEMBL215226 N |
ChemSpider |
21106441 Y |
DrugBank |
DB04263 Y |
InChI
-
InChI=1S/C20H40N4O10/c1-6(25)14-11(27)10(26)9(23)18(32-14)33-15-7(21)4-8(22)16(12(15)28)34-19-13(29)17(24-3)20(2,30)5-31-19/h6-19,24-30H,4-5,21-23H2,1-3H3/t6-,7-,8+,9+,10+,11-,12-,13+,14?,15+,16-,17+,18+,19+,20-/m0/s1 Y
Key: BRZYSWJRSDMWLG-NQRKCNNJSA-N Y
-
InChI=1/C20H40N4O10/c1-6(25)14-11(27)10(26)9(23)18(32-14)33-15-7(21)4-8(22)16(12(15)28)34-19-13(29)17(24-3)20(2,30)5-31-19/h6-19,24-30H,4-5,21-23H2,1-3H3/t6-,7-,8+,9+,10+,11-,12-,13+,14?,15+,16-,17+,18+,19+,20-/m0/s1
Key: BRZYSWJRSDMWLG-NQRKCNNJBI
|
Jmol-3D images |
Image |
PubChem |
123865 |
SMILES
-
O[C@H]3[C@H](O)[C@@H](N)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H](N)C[C@@H](N)[C@H](O[C@H]1OC[C@](C)(O)[C@H](NC)[C@H]1O)[C@H]2O)OC3[C@@H](O)C
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Properties |
Chemical formula
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C20H40N4O10 |
Molar mass |
496.56 g·mol−1 |
Solubility in water
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50 mg/mL |
Except where otherwise noted, data are given for materials in their standard state (at 25 °C [77 °F], 100 kPa).
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N verify (what is: Y/N?) |
Infobox references |
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G418 (Geneticin) is an aminoglycoside antibiotic similar in structure to gentamicin B1. It is produced by Micromonospora rhodorangea.[1] G418 blocks polypeptide synthesis by inhibiting the elongation step in both prokaryotic and eukaryotic cells.[1] Resistance to G418 is conferred by the neo gene from Tn5 encoding an aminoglycoside 3'-phosphotransferase, APT 3' II.[1] G418 is commonly used in laboratory research to select genetically engineered cells (typically using the KanMX selectable marker).[2] In general for bacteria and algae concentrations of 5 mg/L or less are used, for mammalian cells concentrations of approximately 400 mg/L are used for selection and 200 mg/L for maintenance. However, optimal concentration for resistant clones selection in mammalian cells depends on the cell line used as well as on the plasmid carrying the resistance gene, therefore antibiotic titration should be done to find the best condition for every experimental system. Titration should be done using antibiotic concentrations ranging from 100 mg/L up to 1400 mg/L. Resistant clones selection could require from 1 to up to 3 weeks.
G418 impurity profile
G418 is produced by fermentation and isolation processes and the G418 producing strain Micromonospora rhodorangea produces many other gentamycins while producing G418. The common impurities of G418 include gentamycin X2, gentamicin A, gentamycin C1, C2, C1a and C2a.[3] The quality of G418 is not based on just the potency, but more on the selectivity defined by the killing curve of the sensitive cells vs the resistant cells. A good G418 product has the lowest LD50 for sensitive cells (such as NIH 3T3) and the highest LD50 (can be up to 5,000 μg/ml) for resistant cells (NIH 3T3 transfected with resistant genes). Gentamycins have almost no selectivity, except gentamycin X2.[4]
References
- ^ a b c "G418". InvivoGen. InvivoGen. Retrieved 18 June 2013.
- ^ "G418". labome.com. Retrieved 2010-01-09.
- ^ G418 impurity profile
- ^ G418 selectivity
English Journal
- Engineered endothelial progenitor cells that overexpress prostacyclin protect vascular cells.
- Liu Q, Xi Y, Terry T, So SP, Mohite A, Zhang J, Wu G, Liu X, Cheng J, Ruan KH, Willerson JT, Dixon RA.SourceThe Texas Heart Institute at St. Luke's Episcopal Hospital, Houston, Texas.
- Journal of cellular physiology.J Cell Physiol.2012 Jul;227(7):2907-16. doi: 10.1002/jcp.23035.
- Prostacyclin (PGI2) is a potent vasodilator and important mediator of vascular homeostasis; however, its clinical use is limited because of its short (<2-min) half-life. Thus, we hypothesize that the use of engineered endothelial progenitor cells (EPCs) that constitutively secrete high levels of
- PMID 21938725
- Silencing of the DEK gene induces apoptosis and senescence in CaSki cervical carcinoma cells via the up-regulation of NF-κB p65.
- Liu K, Feng T, Liu J, Zhong M, Zhang S.Source*Department of Gynecology and Obstetrics, the Shengjing Hospital of China Medical University, Shenyang, Liaoning 110004, People's Republic of China.
- Bioscience reports.Biosci Rep.2012 Jun 1;32(3):323-32.
- The human DEK proto-oncogene has been found to play an important role in autoimmune disease, viral infection and human carcinogenesis. Although it is transcriptionally up-regulated in cervical cancer, its intracellular function and regulation is still unexplored. In the present study, DEK and IκBα
- PMID 22390170
Japanese Journal
- M12-Tet-Off pTRE2pur FLAG mTRAF3細胞株の樹立
- 田邊 香野,坂本 瞳,乾 誠治
- 熊本大学医学部保健学科紀要 9, 27-38, 2013-03-30
- … Firstly, pTet-Off vector was introduced into M12 cells by electroporation and G418 resistant clones were selected which harbored pTet-Off. …
- NAID 110009555909
- 末富 祐太,松田 二子,上野山 賀久,前多 敬一郎,束村 博子,大蔵 聡
- 日本繁殖生物学会 講演要旨集 106(0), OR2-20-OR2-20, 2013
- … ウイルス感染72時間後から2週間,G418を培地に添加して,遺伝子導入された細胞を選抜した。 …
- NAID 130005051073
- 性腺刺激ホルモンは顆粒層細胞のオートファジーを調節する
- 小野山 一郎,後藤 康文,福本 善乃助,李 俊佑,眞鍋 昇
- 日本繁殖生物学会 講演要旨集 106(0), OR1-5-OR1-5, 2013
- … 次にこのベクターをKGN細胞へトランスフェクションし,G418による薬剤選択を行って顆粒層細胞由来安定発現株(GFP-LC3・KGN細胞)を得た。 …
- NAID 130005051056
Related Links
- (2R,3S,4R,5R,6S)-5-amino-6-[(1R,2S,3S,4R,6S)-4,6-diamino-3-[(2R,3R,4R,5R)-. 3,5-dihydroxy-5-methyl-4-methylaminooxan-2-yl]oxy-2-hydroxycyclohexyl]oxy-. 2 -(1-hydroxyethyl)oxane-3,4-diol. 別称. ジェネティシン. 識別情報. CAS登録番号 ...
- アプリケーション. ジェネティシン (G418) はトランスポゾンTn5及びTn601由来 ネオマイシン (neo) 耐性遺伝子を安定的に導入した真核細胞を選択,維持するために 使用されます. トランスポゾンTn5とTn601からのネオマイシン(neo)の安定な形質導入 真核細胞 ...
★リンクテーブル★
[★]
ジェネテシン
- 関
- antibiotic G418、G418
[★]
- 英
- Geneticin、G418
- 関
- 抗生物質G418
[★]
- 英
- antibiotic G418、G418
- 関
- ジェネテシン
[★]
抗生物質G418
- 関
- G418、Geneticin