Japanese Journal
- アライメントアルゴリズムの改良
- 中村 卓,佐藤 圭子
- 情報処理学会研究報告. BIO, バイオ情報学 2007(89), 79-86, 2007-09-13
- 動的計画法を用いたアライメントは,配列間の差異を最小にする(あるいは配列間のスコアを最大にする)ようなアライメント結果を得ることができる.しかし,そのアライメント結果が複数生じる場合があり,その結果から最も確からしいと思われる一つを選択する方法はまだ確定していない.また,各アミノ酸間(あるいは塩基間)やアミノ酸とギャップ間の差異の定義の仕方によって,得られる結果はもちろん異なってくる.したがって, …
- NAID 110006402736
- タンパク質の立体構造を考慮したアミノ酸配列のマルチプルアライメント
- 黒岩 達雄,大矢 雅則
- 電子情報通信学会技術研究報告. IT, 情報理論 98(211), 55-60, 1998-07-24
- … ミノ酸配列または塩基配列のアライメントが最初に行われなければならない.Needleman & Wunschがコンピュータによってアライメントを行うアルゴリズムを開発後さまざまな研究が行われてきた.本論文では, マルチプルアライメントの方法として, シミュレーテッドアニーリングをベースとして, アミノ酸の結合角度分布であるラマチャンドランプロットで表すタンパク質の立体構造を考慮した新たなアルゴリズムを提案する. …
- NAID 110003197499
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