長散在型反復配列

出典: meddic

long interspersed nucleotide element、long interspersed nuclear element、LINE
長い散在反復配列長い散在性反復配列LINE-1配列長鎖散在反復配列L1配列

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知恵蔵2013 SINEの用語解説 - 短鎖散在反復配列ともいう。高等生物のゲノムには、特定の塩基配列が何回も繰り返し存在している。これを反復配列といい、ゲノムの特定の場所に反復が集中する直列型と、ゲノム内に散らばる散在型がある。
長鎖散在性反復配列(LINE) 10 LINEの構造 11 LINEによる遺伝子重複 12 短鎖散在性反復配列(SINE) ... 2004/1/27: ゲノムの中の反復配列 ゲノムの中の反復配列 佐賀大学農学部 和田康彦 ...

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関連記事配列」「散在」「反復配列」「反復」「

LINE」

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長い散在反復配列長散在型反復配列長い散在性反復配列ライン、広範囲散在反復配列
long interspersed nuclear element, long interspersed nucleotide element, long interspersed element, long interspersed repetitive elements, LINEs, long interspersed repeat sequences
レトロトランスポゾン
quoted from http://en.wikipedia.org/wiki/Long_interspersed_nucleotide_elements#LINEs
  • Long interspersed nuclear elements[8] are a group of genetic elements that are found in large numbers in eukaryotic genomes. They are transcribed (or are the evolutionary remains of what was once transcribed) to an RNA using an RNA polymerase II promoter that resides inside the LINE. LINEs code for the enzyme reverse transcriptase, and many LINEs also code for an endonuclease (e.g. RNase H). The reverse transcriptase has a higher specificity for the LINE RNA than other RNA, and makes a DNA copy of the RNA that can be integrated into the genome at a new site.
  • The 5' UTR contains the promoter sequence, while the 3' UTR contains a polyadenylation signal (AATAAA) and a poly-A tail.[10] Because LINEs move by copying themselves (instead of moving, like transposons do), they enlarge the genome. The human genome, for example, contains about 20,000-40,000 LINEs, which is roughly 21% of the genome.


long interspersed nucleotide element」

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L1 elementLINELINE-1 element、long interspersed element、long interspersed nuclear element


長い散在性反復配列」

  [★]

long interspersed element、long interspersed nuclear element、long interspersed nucleotide elementLINE
長散在型反復配列長い散在反復配列長鎖散在反復配列


長鎖散在反復配列」

  [★]

long interspersed nucleotide element
長散在型反復配列長い散在反復配列長い散在性反復配列


L1配列」

  [★]

L1 element
長散在型反復配列LINE-1配列L1領域


配列」

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sequencearrangementarrayconstellationarrangesequential
協定経時的系列結果シークエンスシーケンス順序準備筋道整列取り計らう配置配列決定連続連続的逐次結果としての時系列並べるアレイ順次整理


PHP関数

array_unique()

	for ( $i = 0 ; $i < 5 ; $i++ ) {
		$a['w'][$i] = $i+100;
		$a['m'][$i] = 1;
	}
	for ( $i = 5 ; $i < 15 ; $i++ ) {
		$a['w'][$i] = $i+100;
		$a['m'][$i] = 2;
	}
	for ( $i = 15 ; $i < 20 ; $i++ ) {
		$a['w'][$i] = $i+100;
		$a['m'][$i] = 3;
	}

	$a['w'][5]=100;
	$a['w'][15]=100;

var_dump($a);
	$b = array_unique($a['w']); #配列 重複キー 消去

var_dump($b);

-----
array(2) { 
	["w"]=> array(20) 
		{
			[0]=> int(100) [1]=> int(101) [2]=> int(102) [3]=> int(103) [4]=> int(104) [5]=> int(100) [6]=> int(106) [7]=> int(107) [8]=> int(108) [9]=> int(109) [10]=> int(110) [11]=> int(111) [12]=> int(112) [13]=> int(113) [14]=> int(114) [15]=> int(100) [16]=> int(116) [17]=> int(117) [18]=> int(118) [19]=> int(119) } 
	["m"]=> array(20) 
		{
			[0]=> int(1) [1]=> int(1) [2]=> int(1) [3]=> int(1) [4]=> int(1) [5]=> int(2) [6]=> int(2) [7]=> int(2) [8]=> int(2) [9]=> int(2) [10]=> int(2) [11]=> int(2) [12]=> int(2) [13]=> int(2) [14]=> int(2) [15]=> int(3) [16]=> int(3) [17]=> int(3) [18]=> int(3) [19]=> int(3) } } 

array(18) {
			[0]=> int(100) [1]=> int(101) [2]=> int(102) [3]=> int(103) [4]=> int(104) [6]=> int(106) [7]=> int(107) [8]=> int(108) [9]=> int(109) [10]=> int(110) [11]=> int(111) [12]=> int(112) [13]=> int(113) [14]=> int(114) [16]=> int(116) [17]=> int(117) [18]=> int(118) [19]=> int(119) } 

配列の要素の除去

array_pop

  • 配列のインデックスから、末尾にあるインデックス1つを取り除く。指定した変数の配列が空だった場合には、null が帰される。

配列の結合

  • 1. +演算子。同じキーを上書きする。
  • 2. array_push(array, array)とすると、出力が array([0]->array, [1]->array)になる。
  • 3. array_match(out_array, add_array)これでokだが、add_array = array();だとエラーが起こるので、適当なトラップが必要。 ← array_mergeの間違えでしょ?

配列要素の結合

$str = implode('/',$array);

配列の要素表示

  • var_dump()
  • print_r();


散在」

  [★]

disseminationdisseminateinterspersedispersedinterspersed
散らばった転移播種汎発分散分散型内転移


反復配列」

  [★]

repetitive sequence, repeated sequence
繰返し配列繰り返し配列


反復」

  [★]

iteration(PSY), repetition(IMD)
  • 同じ行動や思考を繰り返すこと。



列」

  [★]

rowtiertrain
作条訓練、層、



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