ヘアピンループ

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hairpin loop

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和文文献

  • 相互作用RNA2次構造予測 : 形式文法によるアプローチ
  • 加藤 有己,阿久 津達也,関 浩之
  • 情報処理学会研究報告. MPS, 数理モデル化と問題解決研究報告 2007(128), 129-136, 2007-12-20
  • 遺伝子発現の転写後調節に係わるRNA間の相互作用が注目されている.これまで動的計画法に基づいて相互作用するRNAの2次構造予測が行われてきたが,形式文法による手法は提案されていなかった.本稿では,多重文脈自由文法(MCFG)に基づいてRNA間相互作用をモデル化する方法を提案する.まず,MCFGの確率的拡張モデルに対して,確率最大の導出木を計算する多項式時間の構文解析アルゴリズムを与える.これはキッ …
  • NAID 110006595412
  • 相互作用RNA2次構造予測 : 形式文法によるアプローチ
  • 加藤 有己,阿久津 達也,関 浩之
  • 情報処理学会研究報告. BIO, バイオ情報学 2007(128), 129-136, 2007-12-20
  • 遺伝子発現の転写後調節に係わるRNA間の相互作用が注目されている.これまで動的計画法に基づいて相互作用するRNAの2次構造予測が行われてきたが,形式文法による手法は提案されていなかった.本稿では,多重文脈自由文法(MCFG)に基づいてRNA間相互作用をモデル化する方法を提案する.まず,MCFGの確率的拡張モデルに対して,確率最大の導出木を計算する多項式時間の構文解析アルゴリズムを与える.これはキッ …
  • NAID 110006594836
  • 形式文法に基づくRNA2次構造予測(若手研究者のための講演会)
  • 加藤 有己,関 浩之,阿久津 達也
  • 電子情報通信学会技術研究報告. IT, 情報理論 107(354), 7-16, 2007-11-20
  • 近年,形式文法における構文解析技術を応用したRNAの2次構造予測が盛んに研究されている.典型的なRNA配列では塩基対が互いに入れ子になって現れるため,2次構造を文脈自由文法(CFG)でモデル化する試みがなされてきた.一方,いくつかの塩基対が配列上で交差して現れるシュードノットと呼ばれる部分構造や,2つのRNA間の相互作用によるキッシングヘアピンループと呼ばれる結合構造が存在し,CFGでは表現できな …
  • NAID 110006533148

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A ヘアピンループ RNA 順序はのある ヌクレオチド RNA の長い区分が互いに基盤組できるところ、 しかしその順序内の区分は組を基づかせることができない ヘアピンループをもたらすこと。 5' の例か。ヘアピンループ構造をもたらすRNA ...

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ヘアピンループRNAXe\ASނ̃[v\AуV[hmbg\上記の第2のDNA配列は、下記の べっ甲 ヘアアクセの通販|DeNA 理想タンパク質構造のデザイン pSINsiベクターシリーズ|タカラ


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