- 英
- solvent-accessible surface area
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Japanese Journal
- タンパク質の特性に基づく<i>unbound</i>ドッキングのための剛体予測手法の改良
- 松崎 裕介,大上 雅史,松崎 由理 [他],佐藤 智之,関嶋 政和,秋山 泰
- 情報処理学会研究報告. BIO, バイオ情報学 2010-BIO-20(4), 1-8, 2010-02-25
- … である.しかしタンパク質の形状やドッキングにおける構造変化に多様性があるため,目的関数におけるその重みをタンパク質の特性に応じて変化させることにより,予測精度の改善が期待できる.本研究では,溶媒露出面積や表面電荷,溶媒中の構造変化などの個々のタンパク質の特性に基づいて静電重みを決定し,目的関数における形状相補性の寄与を変えることで,unbound ドッキングの予測精度を向上させる方法を提案する. …
- NAID 110007990826
- 1P249 タンパク質-タンパク質相互作用領域の予測 : ニューラルネットワークによる溶媒露出面積変化の予測(生命情報科学(構造ゲノミクス),ポスター発表,第45回日本生物物理学会年会)
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- (Accessible Surface Area, ASA) タンパク質分子の構成原子とvan der Waals 接触が可能な溶媒分子(通常は水:半径1.4Å) の中心点が描く曲面の面積(緑色) 図より、分子3、9、11は溶媒と接触することができず、内部に埋もれて ...
- ノ酸が検知された(表1)。また、溶媒露出面積についての調査の結果では、Free Cysの方がより 疎水性環境にあることも分かった。これは極めて空気酸化を受けやすいFree Cys が酸化されるの を避けるためにタンパク質内部に埋め込まれて ...
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★リンクテーブル★
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- 英
- exposure、expose、(臓器を外に)exteriorize
- 関
- 撮影、曝す、曝露、被曝、露光、外面化
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- 英
- area
- 関
- 区域、地域、範囲、分野、領域、部域
肺胞の面積
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- 英
- solvent、vehicle
- 関
- 媒介物、溶解剤、溶剤、媒体、乗り物、ソルベント
[★]
- 英
- solvent exposure、solvent-accessible