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- residue
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- matter that remains after something has been removed
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- 残り,残余;残留物
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残基(ざんき、英語:residue)とは、合成物質の化学構造において生成する化学結合の構造以外の部分構造を指し示す化学概念や化学用語である。一般には残基という用語は単独で使用されることは少なく、高分子化合物のように一定の化学結合により単量体が連結している場合に、置換基の呼称の後に「~残基」と組み合わせることで部分構造を指し示すために使用される。また概念を示す明確なルールに基づいて区部されるわけではないため、残基部分の境界は曖昧であり、使用される文脈に強く依存する。
残基に相対する化学結合は単結合など(bond)ではなく、化学反応で生成する官能基による結合、たとえばエステル結合、ペプチド結合、グリコシド結合などである。したがって高分子の構造は化学結合部分と残基部分とから構成されることになる。
鎖状分子においては化学構造の部分を示すために、主鎖(primary chain, main chain)と側鎖(side chain, branched chain)という区分をするが、これはトポロジー的な関係に着目した部分構造の分類になる。さもなくばある程度明瞭な中心構造を持つ場合は、母核(scaffold)[1]と「-部分」(moiety)というように分類する場合もある。
具体的には糖鎖、ポリペプチド、ポリヌクレオチドなど生体高分子化合物の特性はその残基部分の配列によりその高分子の特性がさまざまに変化することから残基の概念が頻繁に使用される。
ポリペプチドやたんぱく質の場合は、それらがアミノ酸から合成されることから、通常、残基はポリペプチドのアミド結合(ペプチド結合)以外のアミノ酸構造を意味する。また、ペプチド鎖ではC末端とN末端のアミノ酸はN端残基(N-terminal residue)、C端残基(C-terminal residue)と呼ばれる[2]。
脚注
- ^ 通常、母核部分は分子中に一つしかない。
- ^ amino-acid residue IUPAC GOLDBOOK
関連項目
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Japanese Journal
- グルタチオンS-転移酵素の構造と機能─薬剤による抵抗性発現からの脱却─
- 宮本 徹
- 東京農業大学農学集報 57(4), 247-260, 2013-03-18
- … 本稿では,この GST の触媒機構と多様な機能を計算化学による必須アミノ酸残基の立体配座の視点から解説し,薬剤開発と抵抗性発現のイタチごっこの解消の足がかりを提案する。 …
- NAID 110009558070
- 〈Original Papers〉Gene cloning and characterization of pearl oyster Pinctada fucata α-tubulin
- Miyashital Tomoyuki,Takami Akiko,Sugimoto Yui,Sakai Ayumi,Takagi Ryosuke
- Memoirs of the Faculty of Biology-Oriented Science and Technology of Kinki University 31, 1-8, 2013-03-00
- … さらに、翻訳後修飾部位として、リン酸化を受ける79番目と336番目の残基であるアルギニンとリジンが、また、アセチル化を受ける40番目の残基であるリジンが存在する。 …
- NAID 120005260074
- 中田章宏 ,田村慶一 ,北上始 ,高橋誉文
- 情報処理学会研究報告. MPS, 数理モデル化と問題解決研究報告 2013-MPS-92(13), 1-6, 2013-02-20
- … 蛋白質の類似構造を抽出する手法として蛋白質立体構造アラインメントがある.蛋白質立体構造アラインメントは構造的な類似性を使い,比較する蛋白質同士の残基間の対応関係を求める.蛋白質立体構造アラインメントを組合せ最適化問題として定式化したのが CMO (Contact Map Overlap) 問題である.CMO 問題はコンタクトマップと呼ばれるグラフについて,頂点間のアラインメントにより保存される共通コンタクトと呼ばれる構造 …
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