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出典(authority):フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』「2015/05/14 21:29:26」(JST)
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ジンクフィンガーの模式図。亜鉛は黄緑色で表され、ヒスチジン、システイン2残基ずつと結合している
DNAと結合する、3つのジンクフィンガーを持ったZif268
ジンクフィンガー(Zinc finger)はタンパク質ドメインの大きなスーパーファミリーの1つで、DNAに結合する性質を持つ。ジンクフィンガーは2つの逆平行βシートと1つのαヘリックスからなる。小さすぎて疎水中心を持たないため亜鉛イオンが安定化にとって重要である。
目次
- 1 分類
- 2 構造
- 3 タンパク質
- 4 結合
- 5 関連項目
分類
最もよく研究されたC2H2クラスのジンクフィンガーでは、βシートの2つのシステイン残基とαヘリックスの2つのヒスチジン残基が亜鉛イオンとの結合に関わっていた。ジンクフィンガーの他の2つのクラスはC4とC6である。亜鉛イオンがDNAと結合して特別な構造モチーフを形成するため、ジンクフィンガーは遺伝子調節に重要な役割を果たす。
構造
それぞれのジンクフィンガーの構造はよく保存され、およそ30のアミノ酸残基からなり、ββαフォールドで亜鉛イオンを持つ。αヘリックスはC末端、βシートはN末端に位置する。
Cys-X2-4-Cys-X3-Phe-X5-Leu-X2-His-X3-Hisという保存配列を持つ。
タンパク質
Zif268などの多くの転写因子や調節タンパク質がジンクフィンガーを持つ。これらのタンパク質では通常、DNA二重らせんの主溝とジンクフィンガーのαヘリックスが相互作用する。
初期の神経の発達を調整する、ニューロン特異的な転写因子もジンクフィンガー構造を持つ。
結合
DNAと結合するαヘリックス中のアミノ酸残基は-1、3、6の位置にあり、αヘリックスが部分的に緩むことによりDNAと結合できるようになる。そのほかの位置のアミノ酸は、タンパク質が特定の塩基の位置に配置できるように支援したり、反対の鎖と4番目の結合を作ったりして結合特異性の維持に役立っている。
関連項目
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Japanese Journal
- 4Gp14 ルシフェラーゼ融合ジンクフィンガータンパク質を用いたヒストン修飾解析法の開発(環境工学,廃水処理技術/バイオセンシング,分析化学,一般講演)
- ノックアウトマウスを用いた白血病発症における核内因子CIZ1の機能解析
- 西部 莉央 上田 健 本田 浩章
- 長崎醫學會雜誌 : Nagasaki Igakkai zasshi 87(特集), 233-234, 2012-09-25
- … zinc finger protein 1)は,酵母のツーハイブリッド法を用いた<Oh>Hempの相互作用因子検索から同定されたタンパク質であり,以前にp21結合タンパク質として報告されている2).CIZ1は898アミノ酸からなる3つのジンクフィンガーを含むタンパク質で,タンパク相互作用に必要と考えられるglutamine-rich region,酸性アミノ酸領域,核への局在に必要であるmatrin 3-homologous domain 3 (MH3 domain)を含む核タンパク質である.また大部分のヒトの細 …
- NAID 110009523677
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- ネバネバした指 多くのジンクフィンガーはDNA認識に重要な役割を果たしている。ジンクフィンガーは最初、カエルの卵から得られた 転写因子TFIIIA の中で発見された。これには9つのジンクフィンガーが並んで入っている。
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★リンクテーブル★
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Znフィンガー、ジンクフィンガー、亜鉛フィンガー
- 関
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