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of or relating to feces; "fecal matter" (同)fecal

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出典(authority):フリー百科事典『ウィキペディア（Wikipedia）』「2015/05/18 13:24:36」(JST)

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This is a Gram stain for Enterococcus faecalis under 1000 magnification (bright field microscopy)

Enterococcus faecalis – formerly classified as part of the group D Streptococcus system – is a Gram-positive, commensal bacterium inhabiting the gastrointestinal tracts of humans and other mammals.^[1] Like other species in the genus Enterococcus, E. faecalis can cause life-threatening infections in humans, especially in the nosocomial (hospital) environment, where the naturally high levels of antibiotic resistance found in E. faecalis contribute to its pathogenicity.^[1] E. faecalis has been frequently found in root canal-treated teeth in prevalence values ranging from 30% to 90% of the cases.^[2] Root canal-treated teeth are about nine times more likely to harbor E. faecalis than cases of primary infections.^[3]

Physiology

E. faecalis is a nonmotile, facultatively anaerobic microbe; it ferments glucose without gas production, and does not produce a catalase reaction with hydrogen peroxide. It can produce a pseudocatalase reaction if grown on blood agar. The reaction is usually weak. It produces a reduction of litmus milk, but does not liquefy gelatin. Growth on nutrient broth is consistent with being facultatively anaerobic. They catabolize a variety of energy sources including glycerol, lactate, malate, citrate, arginine, agmatine, and many keto acids. Enterococci survive very harsh environments including extremely alkaline pH (9.6) and salt concentrations. They resist bile salts, detergents, heavy metals, ethanol, azide, and desiccation. They can grow in the range of 10 to 45°C and survive at temperatures of 60°C for 30 min.^[4]

Pathogenesis

E. faecalis can cause endocarditis and bacteremia, urinary tract infections, meningitis, and other infections in humans.^[5]^[6] Several virulence factors are thought to contribute to E. faecalis infections. A plasmid-encoded hemolysin, called the cytolysin, is important for pathogenesis in animal models of infection, and the cytolysin in combination with high-level gentamicin resistance is associated with a five-fold increase in risk of death in human bacteremia patients.^[7]^[8]^[9] A plasmid-encoded factor called "aggregation substance" is also important for virulence in animal models of infection.^[8]^[10]

Antibacterial resistance

E. faecalis is resistant to many commonly used antimicrobial agents (aminoglycosides, aztreonam, cephalosporins, clindamycin, the semisynthetic penicillins nafcillin and oxacillin, and trimethoprim-sulfamethoxazole).^{[citation needed]} Resistance to vancomycin in E. faecalis is becoming more common.^[11]^[12] Treatment options for vancomycin-resistant E. faecalis include nitrofurantoin (in the case of uncomplicated UTIs),^[13] linezolid, and daptomycin, although ampicillin is preferred if the bacteria are susceptible.^[14] Quinupristin/dalfopristin can be used to treat Enterococcus faecium but not E. faecalis.^[14]

In root canal treatments, NaOCl and chlorhexidine(CHX) are used to fight E. faecalis before isolating the canal. However, recent studies determined that NaOCl or CHX showed low ability to eliminate E. faecalis.^[15]

Survival and virulence factors

Endures prolonged periods of nutritional deprivation
Binds to dentin and proficiently invades dentinal tubules
Alters host responses
Suppresses the action of lymphocytes
Possesses lytic enzymes, cytolysin, aggregation substance,pheromones, and lipoteichoic acid
Utilizes serum as a nutritional source
Resists intracanal medicaments (i.e. Ca(OH)₂)
- Maintains pH homeostasis
- Properties of dentin lessen the effect of calcium hydroxide
Competes with other cells
Forms a biofilm^[16]

Historical

Prior to 1984, enterococci were members of the genus Streptococcus; thus, E. faecalis was known as Streptococcus faecalis.^[17]

In 2013, a combination of cold denaturation and NMR spectroscopy was used to show detailed insights into the unfolding of the E. faecalis homodimeric repressor protein CylR2.^[18]

Genome structure

The E. faecalis genome contains 3,22 Mbp with 3,113 protein-coding genes.^[19]

References

^ ^a ^b Ryan KJ, Ray CG (editors) (2004). Sherris Medical Microbiology (4th ed.). McGraw Hill. pp. 294––5. ISBN 0-8385-8529-9.
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^ Stuart et al. 2006
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^ ^a ^b Chow, JW.; Thal, LA.; Perri, MB.; Vazquez, JA.; Donabedian, SM.; Clewell, DB.; Zervos, MJ. (Nov 1993). "Plasmid-associated hemolysin and aggregation substance production contribute to virulence in experimental enterococcal endocarditis". Antimicrob Agents Chemother 37 (11): 2474–7. doi:10.1128/aac.37.11.2474. PMC 192412. PMID 8285637.
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^ Zhanel GG, Hoban DJ, Karlowsky JA; Hoban; Karlowsky (January 2001). "Nitrofurantoin is active against vancomycin-resistant enterococci". Antimicrob. Agents Chemother. 45 (1): 324–6. doi:10.1128/AAC.45.1.324-326.2001. PMC 90284. PMID 11120989.
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^ Estrela, C; Silva, J. A.; De Alencar, A. H.; Leles, C. R.; Decurcio, D. A. (2008). "Efficacy of sodium hypochlorite and chlorhexidine against Enterococcus faecalis--a systematic review". Journal of applied oral science : revista FOB 16 (6): 364–8. PMID 19082392. edit
^ Review Article Stuart et al. JOE 2006
^ Schleifer KH; Kilpper-Balz R (1984). "Transfer of Streptococcus faecalis and Streptococcus faecium to the genus Enterococcus nom. rev. as Enterococcus faecalis comb. nov. and Enterococcus faecium comb. nov". Int. J. Sys. Bacteriol. 34: 31–34. doi:10.1099/00207713-34-1-31.
^ Jaremko, M., Jaremko, L., Kim, H.-Y., Cho, M.-K., Schwieters, C. D., Giller, K., Becker,S., Zweckstetter, M.; Jaremko; Kim; Cho; Schwieters; Giller; Becker; Zweckstetter (2013). "Cold denaturation of a protein dimer monitored at atomicresolution". Nat. Chem. Biol. 9 (4): 264–270. doi:10.1038/nchembio.1181. PMID 23396077.
^ Paulsen, IT.; Banerjei, L.; Myers, GS.; Nelson, KE.; Seshadri, R.; Read, TD.; Fouts, DE.; Eisen, JA. et al. (Mar 2003). "Role of mobile DNA in the evolution of vancomycin-resistant Enterococcus faecalis". Science 299 (5615): 2071–4. doi:10.1126/science.1080613. PMID 12663927.

UpToDate Contents

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1. 腸球菌感染症の治療 treatment of enterococcal infections
2. 腸球菌の微生物学 microbiology of enterococci
3. 腸球菌における抗菌薬耐性の機構 mechanisms of antibiotic resistance in enterococci
4. 固有弁心内膜炎の抗菌療法 antimicrobial therapy of native valve endocarditis
5. 黄色肉芽腫性腎盂腎炎 xanthogranulomatous pyelonephritis

English Journal

Degradation, mineralization and antibiotic inactivation of amoxicillin by UV-A/TiO(2) photocatalysis.

Dimitrakopoulou D, Rethemiotaki I, Frontistis Z, Xekoukoulotakis NP, Venieri D, Mantzavinos D.SourceDepartment of Environmental Engineering, Technical University of Crete, Polytechneioupolis, GR-73100 Chania, Greece.
Journal of environmental management.J Environ Manage.2012 May 15;98:168-74. Epub 2012 Jan 24.
The UV-A/TiO(2) photocatalytic decomposition of amoxicillin (AMX) in aqueous suspensions was investigated. Experiments were performed at antibiotic concentrations between 2.5 and 30 mg/L, eight commercially available TiO(2) catalysts at loadings between 100 and 750 mg/L, acidic or near-neutral con
PMID 22277347

Is the production of the biogenic amines tyramine and putrescine a species-level trait in enterococci?

Ladero V, Fernández M, Calles-Enríquez M, Sánchez-Llana E, Cañedo E, Martín MC, Alvarez MA.SourceInstituto de Productos Lácteos de Asturias, IPLA-CSIC, Crta. de Infiesto s/n, Apdo. de Correos 85, 33300 Villaviciosa, Asturias, Spain.
Food microbiology.Food Microbiol.2012 May;30(1):132-8. Epub 2011 Dec 22.
Biogenic amines (BA) are toxic nitrogenous compounds that can be accumulated in foods via the microbial decarboxylation of certain amino acids. Lactic acid bacteria (LAB) strains belonging to different species and genera have been described as BA producers and are mainly responsible for their synthe
PMID 22265293

Japanese Journal

A群レンサ球菌接種マウスの同一病巣から接種菌と共に同時に分離された変異菌の遺伝子解析の検討

西村俊夫,沼田紀義
医学と生物学 155(1), 53-59, 2011-01
NAID 40018267261

門脈内ガスを認めた急性胃蜂窩織炎の1例

伊藤哲也,米田傑,須藤桃子,長屋匡信,竹中一弘,市川真也,武田龍太郎,須藤貴森,赤松泰次,田中榮司
日本消化器内視鏡学会雑誌 = Gastroenterological endoscopy 52(7), 1698-1705, 2010-07-20
… 善せず，当院にて呼吸管理と経鼻経管栄養，薬物治療を受けていた．経過中に発熱と嘔吐が出現し，血液検査で急性炎症所見を認めた．腹部造影CTでは胃壁全体の肥厚と門脈内ガスがみられた．緊急上部消化管内視鏡および超音波内視鏡検査の所見と併せ，急性胃蜂窩織炎と診断した．胃粘膜および胃液よりEnterobacter aerogenesとEnterococcus faecalisが検出された．抗生物質による保存的治療にて改善した． …
NAID 10026910701

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★リンクテーブル★

国試過去問	「095D057」
リンク元	「細菌」「髄膜炎」「尿路感染症」「腸球菌属」「フェカリス菌」
関連記事	「faecal」「faecalis」

「095D057」

Enterococcus faecalis
Scientific classification
Domain:	Bacteria
Kingdom:	Eubacteria
Phylum:	Firmicutes
Class:	Bacilli
Order:	Lactobacillales
Family:	Enterococcaceae
Genus:	Enterococcus
Species:	E. faecalis
Binomial name
	Enterococcus faecalis;

　　[★]

76歳の男性。微熱と全身倦怠感とが続くため来院した。2か月前に経尿道的前立腺切除術を受けている。心尖部に最強点をもつ3/6度の汎収縮期雑音を聴取する。血液所見：赤沈50mm/1時間、白血球12,500(桿状核好中球10％、分葉核好中球66％、好酸球2％、単球4％、リンパ球18％)。CRP12.6mg/dl(基準0.3以下)。血液培養で予想される起炎菌はどれか。

[正答]

※国試ナビ4※　［095D056］←［国試_095］→［095D058］

「細菌」

　　[★]

英: bacterium,(pl.) bacteria
同: バクテリア
関: 特殊な細菌、細菌の鑑別、細菌の同定？、細菌の分類？

細菌の命名

ラテン語であり、イタリックで表す。
「属名 + 種名」で表現される。

グラム染色性と形状による分類と疾患

形状

球菌

Staphylococcus aureus

多様

ナイセリア属

淋菌

Neisseria gonorrhoeae

淋病

ストレプトコッカス属

化膿性連鎖球菌

Streptococcus pyogenes

多様

莢膜

髄膜炎菌

Neisseria meningitidis

多様

肺炎球菌

Streptococcus pneumoniae

ベイヨネラ属

Veillonella

エンテロコッカス属

(総称)腸球菌

Enterococcus faecalis

モラクセラ属/
ブランハメラ亜属

Moraxella catarrhalis

肺炎

Enterococcus faecium

桿菌

Bacillus anthracis

好気性菌、有芽胞菌、莢膜

肺炎、尿路感染

Bacillus cereus

好気性菌、有芽胞菌

Escherichia coli

通性嫌気性

Clostridium tetani

嫌気性菌、有芽胞菌

下痢、肺炎、尿路感染

Clostridium botulinum

ボツリヌス中毒

プロテウス属

尿路感染

ウェルシュ菌

Clostridium perfringens

多様

サルモネラ属

パラチフス菌

Sallmonella serovar Paratyphi

腸チフス

通性嫌気性

ディフィシル菌

Clostridium difficile

多様

チフス菌

Sallmonella serovar Typhi

通性嫌気性

ガス壊疸菌群

セラチア属

Serratia

日和見感染

通性嫌気性

マイコバクテリウム科

マイコバクテリウム属

結核菌

Mycobacterium tuberculosis

無芽胞菌

Shigella

通性嫌気性

Mycobacterium leprae

Yersinia pestis

通性嫌気性

コリネバクテリウム科

コリネバクテリウム属

ジフテリア菌

Corynebacterium diphtheriae

ジフテリア

Yersinia enterocolitica

多様

通性嫌気性

Vibrio cholerae

通性嫌気性

アクチノマイセス科

アクチノマイセス属(放線菌属)

(総称)放線菌

Actinomyces

腸炎ビブリオ

Vibrio parahaemolyticus

腸炎ビブリオ感染症

通性嫌気性

リステリア属

Listeria monocytogenes

リステリア症

嫌気性菌、無芽胞菌、人獣共通感染症、通性細胞内寄生菌

パスツレラ科

ヘモフィルス属

インフルエンザ菌

Haemophilis influenzae

多様

パスツレラ属

パスツレラ属菌

Pasteurella multocida

人獣共通感染症

ストレプトバシラス属

ストレプトバシラス属菌

Streptobacillus moniliformis

鼠咬症

シュードモナス属

緑膿菌

Psudomonas aeruginosa

緑膿菌感染症

好気性、院内感染症

ボルデテラ属

百日咳菌

Bordetela pertussis

好気性、短桿菌

Brucella

好気性、細胞内増殖菌、短桿菌

Francisella tularensis

野兎病

好気性、球桿菌

レジオネラ属

Legionella pneumophila

ポンティアック熱/レジオネラ肺炎

好気性

バクテロイデス属

Bacteroides fragilis

嫌気性感染症

偏性嫌気性菌

らせん菌

スピロヘータ科

トレポネーマ属

梅毒トレポネーマ

Treponema pallidum subspecies pallidum

梅毒

ボレリア属

回帰熱ボレリア

Borrelia recurrentis

回帰熱

ライム病ボレリア

Borrelia burgdorferi

Leptospira interrogans serovar icterohaemorrhagiae

黄疸出血性レプトスピラ症(レプトスピラ症、ワイル病、黄疸性ワイル病)

？

？

カンピロバクター属菌

？

Helicobacter pylori

「髄膜炎」

　　[★]

英: meningitis
同: 脳脊髄膜炎、
関: 蛋白細胞解離

病因

感染症(細菌、ウイルス、真菌など)、悪性腫瘍の浸潤　→　髄膜の炎症

分類

病原体

細菌性髄膜炎

菌血症→脳脈絡叢→髄腔
菌体成分(LPSなど)→BBB, 上衣細胞、脳細胞の障害。神経膠細胞による炎症サイトカインの分泌

無菌性髄膜炎

血行性、あるいは神経軸索によりウイルスが髄腔に波及。

細菌性髄膜炎：様々
ウイルス性髄膜炎：コクサッキーウイルス、エコーウイルス、ムンプスウイルス、単純ヘルペスウイルス、風疹ウイルス、麻疹ウイルス、水痘・帯状疱疹ウイルス
真菌性髄膜炎：クリプトコッカス髄膜炎
結核性髄膜炎：結核菌
梅毒性髄膜炎：梅毒菌

臨床経過

宿主要因と髄膜炎に関わる病原体

頻度・年齢階層が資料によって異なるため混乱しないように注意。

YN.J-137改変

4ヶ月未満	B群溶連菌(50%)	大腸菌(25%)	インフルエンザ菌(20%)	リステリア菌(1%)
4ヶ月～6歳未満	インフルエンザ菌(70%)	肺炎球菌(25%)
6歳～50歳未満	肺炎球菌(65%)	インフルエンザ菌(10%)	髄膜炎菌
50歳以上	肺炎球菌(80%)	黄色ブドウ球菌
免疫不全者	クレブシエラ	連鎖球菌	緑膿菌	黄色ブドウ球菌	真菌

first aid step1 2006 p.161

Newborn (0–6 mos)	Children (6 mos–6 yrs)	6–60 yrs	60 yrs +
Streptococcus agalactiae	Streptococcus pneumoniae	Neisseria meningitidis	Streptococcus pneumoniae
Escherichia coli	Neisseria meningitidis	Enteroviruses	Gram-negative rods
Listeria	Haemophilus influenzae type B	Streptococcus pneumoniae	Listeria
	Enteroviruses	HSV

HIV: Cryptococcus, CMV, toxoplasmosis (brain abscess), JC virus (PML)

incidence of H. influenzae meningitis has ↓ greatly with introduction of H. influenzae vaccine in last 10–15 years.

CBT QB vol2 p.562

	1位	2位	3位
新生児	大腸菌	B群溶連菌	リステリア菌
小児期(6歳以下)	インフルエンザ菌	肺炎球菌
成人	肺炎球菌	髄膜炎菌

IMD.1042

年齢	病原体
3ヶ月未満	B群溶連菌	大腸菌	リステリア菌
3ヶ月以上の乳小児	インフルエンザ菌	肺炎球菌
成人	肺炎球菌	髄膜炎菌
高齢者	肺炎球菌	グラム陰性桿菌	リステリア菌

小児細菌性髄膜炎起炎菌(PED.606)

		<3か月	3か月≦
グラム陽性	球菌	Streptococcus agalactiae Streptococcus pneumoniae Staphylococcus Enterococcus faecalis	Streptococcus pneumoniae(PSSP/PISP/PRSP)
グラム陽性	桿菌	Listeria monocytogenes	Listeria monocytogenes
グラム陰性	球菌	Neisseria meningitidis	Neisseria meningitidis
グラム陰性	桿菌	Escherichia coli Enterobacter cloacae Serratia marcescens	Haemophilus influenzae type b

新生児

Streptococcus agalactiaeは産道感染
Escherichia coliもおそらく産道感染

新生児と老人

Listeria monocytogenesは産道感染するので新生児に多い。新生児と老人に多いのは通性細胞内寄生菌で細胞性免疫の弱い宿主に感染やすいため？

乳児～幼児

Haemophilus influenzae type B

乳児～大人

Enteroviruses
Neisseria meningitidis

小児～大人

Herpes simplex virus

乳児～老人

Streptococcus pneumoniae

老人

グラム陰性桿菌は老人

髄膜炎の鑑別

	細菌性髄膜炎	ウイルス性髄膜炎	結核性髄膜炎	真菌性髄膜炎	癌性髄膜炎
外観	混濁	clear	水様～キサントクロミー日光微塵	clear～日光微塵	clear～キサントクロミー
圧 70-180 (mmH2O)	↑↑ 200～800以上	↑ 200～300	↑ 200～800	↑ 200～800	↑ 200～300
細胞 0-5 (/mm3)	500～数百万	10～1,000	25～1,000	25～1,000	25～500
細胞 0-5 (/mm3)	好中球	リンパ球	リンパ球	リンパ球	好中球
タンパク 15-45 mg/dl	↑↑ 50～1,500	↑ 正常～100	↑ 50～500	↑ 100～500	↑ 50～500
糖 50-80 mg/dl	↓↓ 0～40	→ 正常	↓↓ ～40	↓↓ ～40	↓ ～40

予後不良因子

入院時の状態に依存する：痙攣、意識レベルの変化、低血圧 (IRE.407)

国試

100F048

「尿路感染症」

　　[★]

英: urinary tract infection, UTI, urinary tract infections, UTIs
関: 尿路感染

定義

尿路(腎、尿管、膀胱、尿道など)の感染症。尿道炎は別に取り扱われるらしい

疫学

尿路感染症は特に女性に多く、30歳になるまでに4人に1人が罹患。
入院患者の1/3は尿路感染症であり、さらにその3/4以上は膀胱カテーテルを留置されいる患者で起こる。

分類

背景

一般細菌の上行性感染によって起こることがほとんどであり、
単純性尿路感染症：尿路に明らかな基礎疾患がない。

急性、20-30歳代の女性に多い

複雑性尿路感染症：尿路に感染を起こしやすくなる基礎疾患がある。

慢性、高齢の男性に多い

部位

上部尿路感染症：腎盂腎炎
下部尿路感染症：膀胱炎

病因

特異性尿路感染症
非特異性尿路感染症

一般的な尿路感染症

病原体

SMB.607

外来患者

院内感染患者

first aid p.162

Ambulatory..E. coli (50-80%), Klebsiella (8-10%).

Staphylococcus saprophyticus (10-30%) is the 2nd most common cause of UTI in young ambulatory women.

Hospital..E. coli, Proteus, Klebsiella, Serratia,Pseudomonas.

感染経路

外尿道口からの上行性感染

病因

冷え、過度の排尿自制、尿流の停滞、経尿道的操作など

症状

腎盂腎炎：発熱、腰痛など、
膀胱炎では頻尿、排尿痛、残尿感、頻尿など

小児科 SPE.615

年長児：

上部：発熱、腰痛
下部：排尿痛、頻尿、尿の混濁

乳幼児：発熱、嘔吐、下痢、食欲不振など非特異的な全身症状
新生児：乳幼児の症状　＋　脱水、体重減少、黄疸など。

検査

尿検査

尿：混濁
尿沈渣：1視野(400倍)5個以上の白血球(膿尿)
尿培養：1ml中10^5個以上の細菌　←　中間尿の定量培養

症状(頻尿、排泄痛、残尿感)ががあれば、これ以下の菌数でも病因的意義がある。

治療

「腸球菌属」

　　[★]

英: Enterococcus
同: Enterococcus属、エンテロコッカス
関: 腸球菌、腸球菌属、Enterococcus属、エンテロコックス、エンテロコッカス属、エンテロコックス属

概念

グラム陽性球菌
通性嫌気性菌：糖を発酵分解、乳酸を産生。
カタラーゼ非産生
腸球菌属のPBPはそもそもβラクタム系抗菌薬との親和性が低いが、特にフェセム系抗菌薬との親和性が低い。ペニシリン系抗菌薬はその中でもマシな方

腸球菌属

Enterococcus faecalis エンテロコッカス・フェシウム：市中感染：○ペニシリン系抗菌薬
Enterococcus faecium エンテロコッカス・フェシウム：院内感染：×ペニシリン系抗菌薬、セフェム系抗菌薬、アミノグリコシド系抗菌薬　○バンコマイシン　△イミペネム

「フェカリス菌」

　　[★]

ラ: Enterococcus faecalis、E. faecalis、(旧学名)Streptococcus faecalis
関: 大便連鎖球菌、大便レンサ球菌、エンテロコッカス・フェカリス

「faecal」

　　[★]

糞便の

関: excrement、faeces、fecal、feces、stool

「faecalis」

　　[★]

Enterococcus faecalis、Alcaligenes faecalis

[Sherris-1] Ryan KJ, Ray CG (editors) (2004). Sherris Medical Microbiology (4th ed.). McGraw Hill. pp. 294––5. ISBN 0-8385-8529-9.

[2] Molander A, Reit C, Dahlen G, Kvist T: Microbiological status of root-filled teeth with apical periodontitis, Int Endod J 31:1, 1998

[3] Rocas, IN, Siquiera JF, Jr., Santos KR: Association of Enterococcus faecalis with different forms of periradicular diseases, J Endod 30:315, 2004.

[4] Stuart et al. 2006

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