配列相同性

英

sequence homology、sequence identity

関

相同配列

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Japanese Journal

• 新規アニサキス主要アレルゲン（Ani s 14）の分子クローニングおよび発現

• 食品衛生学雑誌 56(5), 194-199, 2015
• NAID 130005107805

• 配列相同性に基づくタンパク質のリガンド結合候補部位の評価(機械学習によるバイオデータマインニング,一般)

• 電子情報通信学会技術研究報告. IBISML, 情報論的学習理論と機械学習 114(105), 171-172, 2014-06-18
• NAID 110009925781

• 配列相同性に基づくタンパク質のリガンド結合候補部位の評価(機械学習によるバイオデータマインニング,一般)

• 電子情報通信学会技術研究報告. NC, ニューロコンピューティング 114(104), 171-172, 2014-06-18
• NAID 110009925533

Related Links

• バイオインフォマティクスの基礎実習（ホモロジー検索）

ほとんどの場合、配列類似度（相同性）が高ければ類縁度も高いと考えられるため、 ホモロジー検索は、他のタンパク質よりも配列相同性が有意に高い類似配列を配列 データベース中から検索することになる。実際、新たな生物種のゲノム塩基配列が解読 された ...

• 相同 - Wikipedia

遺伝学では、相同性という言葉はタンパク質のアミノ酸配列や遺伝子の塩基配列が 共通の祖先をもつときに用いられる。この相同性はオーソロジー（種分岐相同性）と パラロジー（遺伝子重複相同性）の二つに分けられる。

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★リンクテーブル★

リンク元	「sequence homology」「相同配列」「sequence identity」
拡張検索	「アミノ酸配列相同性」
関連記事	「配列」「相同性」

「sequence homology」

　　[★]

• 配列相同性

関

homologous sequence、sequence identity

「相同配列」

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英

homologous sequence

関

配列相同性

「sequence identity」

　　[★]

• 配列相同性

関

sequence homology

「アミノ酸配列相同性」

　　[★]

英

amino acid sequence homology

「配列」

　　[★]

英

sequence、arrangement、array、constellation、arrange、sequential

関

協定、経時的、系列、結果、シークエンス、シーケンス、順序、準備、筋道、整列、取り計らう、配置、配列決定、連続、連続的、逐次、結果としての、時系列、並べる、アレイ、順次、整理

PHP関数

array_unique()

	for ( $i = 0 ; $i < 5 ; $i++ ) {
		$a['w'][$i] = $i+100;
		$a['m'][$i] = 1;
	}
	for ( $i = 5 ; $i < 15 ; $i++ ) {
		$a['w'][$i] = $i+100;
		$a['m'][$i] = 2;
	}
	for ( $i = 15 ; $i < 20 ; $i++ ) {
		$a['w'][$i] = $i+100;
		$a['m'][$i] = 3;
	}

	$a['w'][5]=100;
	$a['w'][15]=100;

var_dump($a);
	$b = array_unique($a['w']); #配列 重複キー 消去

var_dump($b);

-----
array(2) { 
	["w"]=> array(20) 
		{
			[0]=> int(100) [1]=> int(101) [2]=> int(102) [3]=> int(103) [4]=> int(104) [5]=> int(100) [6]=> int(106) [7]=> int(107) [8]=> int(108) [9]=> int(109) [10]=> int(110) [11]=> int(111) [12]=> int(112) [13]=> int(113) [14]=> int(114) [15]=> int(100) [16]=> int(116) [17]=> int(117) [18]=> int(118) [19]=> int(119) } 
	["m"]=> array(20) 
		{
			[0]=> int(1) [1]=> int(1) [2]=> int(1) [3]=> int(1) [4]=> int(1) [5]=> int(2) [6]=> int(2) [7]=> int(2) [8]=> int(2) [9]=> int(2) [10]=> int(2) [11]=> int(2) [12]=> int(2) [13]=> int(2) [14]=> int(2) [15]=> int(3) [16]=> int(3) [17]=> int(3) [18]=> int(3) [19]=> int(3) } } 

array(18) {
			[0]=> int(100) [1]=> int(101) [2]=> int(102) [3]=> int(103) [4]=> int(104) [6]=> int(106) [7]=> int(107) [8]=> int(108) [9]=> int(109) [10]=> int(110) [11]=> int(111) [12]=> int(112) [13]=> int(113) [14]=> int(114) [16]=> int(116) [17]=> int(117) [18]=> int(118) [19]=> int(119) } 

配列の要素の除去

array_pop

• 配列のインデックスから、末尾にあるインデックス１つを取り除く。指定した変数の配列が空だった場合には、null が帰される。

配列の結合

• 1. +演算子。同じキーを上書きする。
• 2. array_push(array, array)とすると、出力が array([0]->array, [1]->array)になる。
• 3. array_match(out_array, add_array)これでokだが、add_array = array();だとエラーが起こるので、適当なトラップが必要。　←　array_mergeの間違えでしょ？

配列要素の結合

• implodeを用いる

$str = implode('/',$array);

配列の要素表示

• var_dump()
• print_r();

「相同性」

　　[★]

英

homology、homologous

関

相同、相同的、同属、同族、ホモロジー、類似

-homology