系統樹

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出典(authority):フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』「2013/02/01 19:28:54」(JST)

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和文文献

  • SDBP: スピーディー・ダブルブートストラップ法に基づいた系統樹の信頼性評価のためのRパッケージ
  • 任 愛珍,石田 貴士,秋山 泰
  • 情報処理学会研究報告. MPS, 数理モデル化と問題解決研究報告 2013-MPS-94(4), 1-4, 2013-07-15
  • … 分子系統樹の信頼性評価は,分子系統学だけではなく,生物の系統樹に依存する他の分野にも重要である.ブートストラップ法はモデルの信頼性評価では一般的に使われている非常に有名な手法であるが,その精度が低いので,様々な試みがなされている.その中の1つに,我々が提案したスピーディー・ダブルブートストラップ法と呼ぶ手法がある.我々の評価によれば,系統樹の信頼性評 …
  • NAID 110009586918
  • 動的計画法を用いた有向二値完全系統樹の効率のよい列挙
  • 森戸 一貴,斎藤 寿樹,山口 一章,増田 澄男
  • 情報処理学会研究報告. AL, アルゴリズム研究会報告 2013-AL-144(10), 1-8, 2013-05-10
  • … 本論文では,不完全なデータから有向二値完全系統樹の列挙について扱う.近年,Kiyomiらによって,ZDDと呼ばれる組合せ集合をコンパクトに表現するデータ構造を用いた有向二値完全系統樹の列挙アルゴリズムが提案された.ZDDには豊富な演算体系があり,Kiyomiらのアルゴリズムはこれらの演算を用いて,すべての有向二値完全系統樹を保持するZDDを構築する.一方,KnuthによるZDDを用いたグ …
  • NAID 110009579686
  • 豚糞尿スラリーを原料としたメタン発酵消化液の微生物群集構造
  • 佐伯 雄一,園田 亮一,城 惣吉,矢野 翼,赤木 功,山本 昭洋,杉本 安寛,Saeki Yuichi,Sonoda Ryoichi,Shiro Sokichi,Yano Tsubasa,Akagi Isao,Yamamoto Akihiro,Sugimoto Yasuhiro,サエキ ユウイチ,ソノダ リョウイチ,シロ ソウキチ,ヤノ ツバサ,アカギ イサオ,ヤマモト アキヒロ,スギモト ヤスヒロ
  • 宮崎大学農学部研究報告 59, 19-28, 2013-03-22
  • … さらに得られた配列データとデータベースから抽出した配列データを基にClustalWによるアライメントの後, 近隣結合法による系統樹の構築を行ない, 検出された微生物の16S rRNA遺伝子の分類を行った. …
  • NAID 110009573745

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より正確には、系統樹とは、共通祖先を有すると考えられるいろいろな生物種(あるいは それらの含む細胞内小器官(ミトコンドリア、葉緑体)や遺伝子(あるいはタンパク質の アミノ酸配列)など)の間の進化的関係を樹木状に表現した図(樹状図)である。 枝分かれは ...
分子系統樹の作成. 1.近隣結合法による系統樹の作成とブートストラップ・テスト. (1) MEGAメインウィンドウからデータファイルをオープンする。 (2) メインメニュから [ Phylogeny]-[Construct Phylogeny]-[Neighbor-Joining(NJ)] をクリックする。 (3) DNA塩基 ...

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ヘッケルの系統樹TTVの分子系統樹進化系統樹ヘボのアルバム 』全生物の進化系統樹図3 多細胞生物の系統樹


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