塩基配列

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base sequence
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base sequence

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出典(authority):フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』「2014/02/07 06:21:43」(JST)

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和文文献

  • 近縁種ゲノム配列を用いたヒトゲノム配列未決定領域の塩基配列決定
  • 福尾 悠平,山根 翔太郎,小柳 香奈子,渡邉 日出海
  • 情報処理学会研究報告. BIO, バイオ情報学 2012-BIO-28(6), 1-2, 2012-03-21
  • … 本研究ではヒトに近縁な霊長類のゲノム配列を利用することで、ヒトゲノム配列未決定領域の塩基配列決定を行った。 …
  • NAID 110008803111
  • 近隣リードを考慮したショートリードクラスタリングによる塩基配列構造情報の有向非循環グラフ表現
  • 上田 大介,瀬尾 茂人,竹中 要一,松田 秀雄
  • 情報処理学会研究報告. MPS, 数理モデル化と問題解決研究報告 2012-MPS-87(27), 1-2, 2012-02-23
  • … 本研究では高速シーケンサが出力するショートリードを用いて DNA 塩基配列構造の有向非循環グラフ表現を提案する.解析対象となる DNA を断片的に読み取ったショートリードはサンプル特有の塩基配列構造情報を内在している.それらを抽出するためにショートリードクラスタリングが行われるが,従来のクラスタの表示法では構造情報の抽出が難しい.そこで我々は近隣リードを考慮したショートリー …
  • NAID 110008791157

関連リンク

生物学における塩基配列(えんきはいれつ)とは、DNA、RNAなどの核酸において、それ を構成しているヌクレオチドの結合順を、ヌクレオチドの一部をなす有機塩基類の種類に 注目して記述する方法、あるいは記述したもののこと。 核酸の塩基配列のことを、単に ...

関連画像

SK+ の MCS の塩基配列を 図 6 に ゲノムの塩基配列を見てみる。 塩基配列と対応するアミノ酸 の構造(塩基配列の一部塩基配列を示したものです 塩基配列


★リンクテーブル★
リンク元核酸配列」「base sequence」「DNA配列」「ヌクレオチド配列」「nucleic acid sequence
拡張検索DNA塩基配列決定法」「塩基配列決定法」「DNA塩基配列認識」「塩基配列認識
関連記事配列」「

核酸配列」

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nucleotide sequencenucleic acid sequence
塩基配列ヌクレオチド配列DNA配列RNA配列


base sequence」

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  • 塩基配列
DNA sequencenucleic acid sequencenucleotide sequenceRNA sequence

DNA配列」

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DNA sequence
塩基配列核酸配列RNA配列DNA塩基配列


ヌクレオチド配列」

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nucleotide sequence
塩基配列base sequence
DNARNA


nucleic acid sequence」

  [★]

base sequencenucleotide sequence


DNA塩基配列決定法」

  [★]

DNA sequencing method, DNA sequencing technique
DNAシークエンス法
ヒト・ゲノム計画


塩基配列決定法」

  [★]

sequencing
シークエンシングシーケンシング配列決定塩基配列決定


DNA塩基配列認識」

  [★]

DNA base sequence recognition
塩基配列認識


塩基配列認識」

  [★]

base sequence recognition


配列」

  [★]

sequencearrangementarrayconstellationarrangesequential
協定経時的系列結果シークエンスシーケンス順序準備筋道整列取り計らう配置配列決定連続連続的逐次結果としての時系列並べるアレイ順次整理


PHP関数

array_unique()

	for ( $i = 0 ; $i < 5 ; $i++ ) {
		$a['w'][$i] = $i+100;
		$a['m'][$i] = 1;
	}
	for ( $i = 5 ; $i < 15 ; $i++ ) {
		$a['w'][$i] = $i+100;
		$a['m'][$i] = 2;
	}
	for ( $i = 15 ; $i < 20 ; $i++ ) {
		$a['w'][$i] = $i+100;
		$a['m'][$i] = 3;
	}

	$a['w'][5]=100;
	$a['w'][15]=100;

var_dump($a);
	$b = array_unique($a['w']); #配列 重複キー 消去

var_dump($b);

-----
array(2) { 
	["w"]=> array(20) 
		{
			[0]=> int(100) [1]=> int(101) [2]=> int(102) [3]=> int(103) [4]=> int(104) [5]=> int(100) [6]=> int(106) [7]=> int(107) [8]=> int(108) [9]=> int(109) [10]=> int(110) [11]=> int(111) [12]=> int(112) [13]=> int(113) [14]=> int(114) [15]=> int(100) [16]=> int(116) [17]=> int(117) [18]=> int(118) [19]=> int(119) } 
	["m"]=> array(20) 
		{
			[0]=> int(1) [1]=> int(1) [2]=> int(1) [3]=> int(1) [4]=> int(1) [5]=> int(2) [6]=> int(2) [7]=> int(2) [8]=> int(2) [9]=> int(2) [10]=> int(2) [11]=> int(2) [12]=> int(2) [13]=> int(2) [14]=> int(2) [15]=> int(3) [16]=> int(3) [17]=> int(3) [18]=> int(3) [19]=> int(3) } } 

array(18) {
			[0]=> int(100) [1]=> int(101) [2]=> int(102) [3]=> int(103) [4]=> int(104) [6]=> int(106) [7]=> int(107) [8]=> int(108) [9]=> int(109) [10]=> int(110) [11]=> int(111) [12]=> int(112) [13]=> int(113) [14]=> int(114) [16]=> int(116) [17]=> int(117) [18]=> int(118) [19]=> int(119) } 

配列の要素の除去

array_pop

  • 配列のインデックスから、末尾にあるインデックス1つを取り除く。指定した変数の配列が空だった場合には、null が帰される。

配列の結合

  • 1. +演算子。同じキーを上書きする。
  • 2. array_push(array, array)とすると、出力が array([0]->array, [1]->array)になる。
  • 3. array_match(out_array, add_array)これでokだが、add_array = array();だとエラーが起こるので、適当なトラップが必要。 ← array_mergeの間違えでしょ?

配列要素の結合

$str = implode('/',$array);

配列の要素表示

  • var_dump()
  • print_r();


列」

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rowtiertrain
作条訓練、層、



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