出典(authority):フリー百科事典『ウィキペディア(Wikipedia)』「2015/09/03 17:11:55」(JST)
ペプチド配列(Peptide sequence)またはアミノ酸配列(Amino acid sequence)は、ペプチドやタンパク質の鎖中、ペプチド結合で繋がったアミノ酸の並び順である。配列は、通常、自由なアミノ基を持つN末端側から、自由なカルボキシル基を持つC末端側に向かって表記される。ペプチド配列は、タンパク質の一次構造となることから、タンパク質配列(Protein sequence)と呼ばれることもある。
ペプチド配列の多くは、配列データベースに登録される。これらのデータベースは、ペプチド配列を表記するために様々な記法を用いている。アミノ酸名をそのまま用いることは滅多になく、その代わり、3文字か1文字の記号で簡潔に表記されることが多い。
配列自体から、様々な推論を行うことができる。疎水性残基が長く続く部分は、貫膜ドメインである可能性が高く、このペプチドが受容体であることを示唆する。また別の特定の配列は、その部分がβシート構造であることを示す。タンパク質の全長配列が得られれば、タンパク質の等電点を推定することができる。ペプチド配列の決定には、DNA配列からの推測、エドマン分解、質量分析法等の方法がある。
ペプチドについてより深く知るためには、配列分析が行われる。この技術では、通常、ある配列が配列データベース中の、既に研究された他の配列と比較される。
全文を閲覧するには購読必要です。 To read the full text you will need to subscribe.
関連記事 | 「配列」「列」 |
for ( $i = 0 ; $i < 5 ; $i++ ) { $a['w'][$i] = $i+100; $a['m'][$i] = 1; } for ( $i = 5 ; $i < 15 ; $i++ ) { $a['w'][$i] = $i+100; $a['m'][$i] = 2; } for ( $i = 15 ; $i < 20 ; $i++ ) { $a['w'][$i] = $i+100; $a['m'][$i] = 3; } $a['w'][5]=100; $a['w'][15]=100; var_dump($a); $b = array_unique($a['w']); #配列 重複キー 消去 var_dump($b); ----- array(2) { ["w"]=> array(20) { [0]=> int(100) [1]=> int(101) [2]=> int(102) [3]=> int(103) [4]=> int(104) [5]=> int(100) [6]=> int(106) [7]=> int(107) [8]=> int(108) [9]=> int(109) [10]=> int(110) [11]=> int(111) [12]=> int(112) [13]=> int(113) [14]=> int(114) [15]=> int(100) [16]=> int(116) [17]=> int(117) [18]=> int(118) [19]=> int(119) } ["m"]=> array(20) { [0]=> int(1) [1]=> int(1) [2]=> int(1) [3]=> int(1) [4]=> int(1) [5]=> int(2) [6]=> int(2) [7]=> int(2) [8]=> int(2) [9]=> int(2) [10]=> int(2) [11]=> int(2) [12]=> int(2) [13]=> int(2) [14]=> int(2) [15]=> int(3) [16]=> int(3) [17]=> int(3) [18]=> int(3) [19]=> int(3) } } array(18) { [0]=> int(100) [1]=> int(101) [2]=> int(102) [3]=> int(103) [4]=> int(104) [6]=> int(106) [7]=> int(107) [8]=> int(108) [9]=> int(109) [10]=> int(110) [11]=> int(111) [12]=> int(112) [13]=> int(113) [14]=> int(114) [16]=> int(116) [17]=> int(117) [18]=> int(118) [19]=> int(119) }
$str = implode('/',$array);
.